Het verband tussen adipositas en borstkankerbiologie ontrafelen door in silico-analyse van bulk- en eencellige omics-gegevens

Borstkanker (BC) is een van de meest voorkomende vormen van kanker en treft wereldwijd 2,1 miljoen vrouwen per jaar, terwijl het ook een aanzienlijk hoog sterftecijfer heeft - volgens de WHO ongeveer 30% in 2018. Obesitas is een ander medisch probleem dat een grote zorg wordt vanwege de toenemende prevalentie (3 keer tussen 1975 en 2016 wereldwijd). Het verband tussen een verhoogd risico en / of een slechte prognose van BC en obesitas is vastgesteld en de klinische relevantie ervan, vooral bij postmenopauzale vrouwen met overgewicht en obesitas, wordt algemeen erkend. Door de jaren heen zijn er veel inspanningen geleverd om de moleculaire karakterisering van BC-tumoren op genomische, transcriptomische, proteomische, epigenetische niveaus en profilering van immuuncelpopulaties. Deze bevindingen toonden de waardevolle bijdrage van omics-benaderingen aan bij het begrijpen van de ziekte, het begeleiden van klinische beslissingen en het ontdekken van nieuwe behandelingsopties. Tot nu toe werd de impact van adipositas echter niet in aanmerking genomen in eerdere studies, waardoor er lacunes in de kennis over hoe moleculaire profielen en de tumorbiologie van BC verschillen volgens adipositas, en hoe deze verschillen zijn gerelateerd aan risiconiveau, prognose, behandelingsresistentie en aanwezigheid van mogelijke behandelingsdoelen. Gebaseerd op de algemene hypothese dat het moleculaire en immuunlandschap van BC-tumoren kunnen verschillen naargelang de adipositas van de patiënt, beoogt dit project eerst gegeneraliseerde differentiërende patronen van tumormoleculaire en immuunprofielen vast te stellen in verschillende groepen van adipositas. Het volgende doel is om specifieke adipositasafhankelijke kenmerken te selecteren die bekende of potentiële prognostische waarde hebben en te onderzoeken hoe en in welke mate hun impact op ziekteprogressie en prognose verandert ten opzichte van adipositas. Ten slotte willen we een ruimtelijke atlas construeren van de micro-omgeving van de BC-tumor volgens adipositas. State-of-the-art bioinformatica-methoden zullen worden gebruikt en we proberen een efficiënte en uitgebreide data-analysestrategie te ontwikkelen om de beschikbare gegevens effectief te ontginnen en de onderzoeksvragen met succes te beantwoorden. We willen onze bevindingen ook delen met de gemeenschap via een webtool die is bedoeld voor het opvragen en visualiseren van de resultaten van het onderzoek.