< Terug naar vorige pagina

Project

Het lysosomale exonuclease PLD3 als een regulator van de endolysosomale flux: impact op neuronale homeostase en relevantie in neurodegeneratie.

 De late vorm van de ziekte van Alzheimer (LOAD) wordt gekenmerkt door endolysomale dysfuncties in transport en degradatie die optreden in vroege preklinische stadia en geleidelijk verergeren. Ik focus me op de neuron-specifieke LOAD-risicofactor fosfolipase D (PLD)-3, dewelke gelokaliseerd is in late endosomen/lysosomen. PLD3 is echter geen lipase maar een exonuclease dat ssDNA afbreekt. Ik ga de functionele link tussen PLD3 en lysosomale homeostase ontrafelen, uitgaande van drie doelstellingen. (1) Een crosslink-IP-sequencing benadering zal me toelaten PLD3-specifieke DNA-substraten te identificeren. (2) Deze zullen gelinkt worden aan cellulaire organellen en mechanismen m.b.v. functionele assays en microscopie, waaronder superresolutie- en elektronenmicroscopie. (3) Deze nieuwe kennis zal tenslotte gecombineerd worden met proteoom- en lipidoomanalyses van magnetisch geïsoleerde lysosomen (wildtype en afgeleid van PLD3 SNP/knock-outs). Hieruit kunnen ontregelde cellulaire routes geïdentificeerd worden die zullen gevalideerd worden in controle en patiënt-afgeleide neuronen en in vivo, in APP knock-in muizen deficiënt voor PLD3. Het koppelen van lysosomale exonuclease-dysfunctie aan neurodegeneratie zal fundamentele nieuwe inzichten verschaffen omtrent de fysiologische relevantie van lysosomale ssDNA afbraak, welke impact dit heeft op neuronale homeostase alsook verdere ondersteuning geven aan endolysosomale dysfunctie als gemeenschappelijke noemer in neurodegeneratie.
 

Datum:1 okt 2020 →  30 sep 2023
Trefwoorden:Lysosomal exonuclease activity, endo-lysosomal homeostasis, late-onset Alzheimer’s disease
Disciplines:Membraanstructuur en -transport, Intracellulaire compartimenten en transport, Moleculaire en celbiologie niet elders geclassificeerd, Neurologische en neuromusculaire ziekten