Het complementair karakter van ribosoom profilering en positionele proteoom analyse voor de annotatie van translatie startplaatsen en de studie van co-translationele eiwitmodificaties in humane cellijnen.

Analyses van de sequentie en de aard van alle eiwitten amino-uiteinden (N-uiteinden) in Proteoomwijde (N-terminome) in eukaryoten tonen een sterk onderschat optreden database nonannotated alternatieve vertaalt, waardoor de reeds hoge complexiteit van proteomen verhogen. Nterminomics geeft kwantitatieve informatie over de N-terminale modificatie staten van geïdentificeerde eiwitten. Ribosoom profilering, een recent ontwikkelde methode genomics, maakt een systematische controle van eiwittranslatie beurzen van diepe sequencen van mRNA ribosoom beschermde fragmenten en maakt daardoor de studie van (alternatieve) translation (initiatie) met subcodon resolutie. Combineren van N-terminomics met ribosoom profilering de afbakening van verschillende dynamische parameters, inclusief translatie efficiëntie en het voorkomen van translatie afslaan, die diepgaande informatie zou onthullen over de nog onvolledig begrepen kwantitatieve aard van translatie initiatie en geassocieerde co-translationele N- toestaan eindproteïne modificaties (bijvoorbeeld proteïne N-terminale acetylering). -Bioinformatica geassisteerde integratie van massaspectrometrie en ribosoom profiling data wordt hier gepresenteerd om zijn potentieel voor (her) annoteren van de translatie-initiatie landschap in de menselijke om de dynamica en regelgeving te bestuderen getuigen. Verder zal ribosoom selectieve profilering worden gebruikt om de substraatspecificiteit en samenspel van ribosoom-geassocieerde ontluikende keten inwerkende factoren te bestuderen op het genoom niveau.