Graaf-analyse voor computationele biologie

Computationele biologie data heeft vaak een complexe structuur.  Het is bekend dat grafen een goede representatie vormen voor dergelijke onderling verbonden gegevens. Graaf-analyse behelst het uitvoeren van datamining op dergelijke graaf-gestructureerde gegevens. Twee belangrijke uitdagingen zijn de computationele kost van graaf-algoritmen en het feit dat de gegevens vaak niet onafhankelijk zijn. Onlangs is er vooruitgang geboekt in de aanpak van beide problemen. In dit project zullen we rekening houden met de specifieke structuur van de computationele biologie gegevens (genomics en proteomics) en er gespecialiseerde datamining-algoritmen voor ontwikkelen.