Gedetailleerde profilering van proximale eiwitten voor endogeen p53 in darm kanker cellen

Het blijft een enorme uitdaging om de eiwitcomplexen in de cel in kaart te brengen. Deze in kaart brengen
complexen is belangrijk omdat ze in wezen de machines zijn die alle processen binnenin uitvoeren
de cel. Ondanks meer dan 30 methoden die momenteel beschikbaar zijn, is er nog steeds geen enkele aanpak
toegepast voor alle soorten interacties tussen eiwitten. In dit project bestuderen we het TP53-gen. een geen
dat is gemuteerd in meer dan 50% van alle kankers en dat is bijna 40 jaar bestudeerd. Dit heeft
resulteerde in een ingewikkeld netwerk rond het genproduct, het p53-eiwit. Sommige echter
belangrijke vragen blijven nog steeds in het veld. Bijvoorbeeld de werkelijke samenstelling van de p53
complexen wordt beschouwd als een van de belangrijkste kortetermijndoelen, niet in het minst omdat dit zou gebeuren
hulp aanzienlijk voor de therapeutische targeting van het eiwit. We hebben onlangs de BioID toegepast
eiwitcomplex mapping-technologie op het p53-eiwit. In tegenstelling tot alle andere onderzoekers die gebruiken
kunstmatige constructies voor deze benadering, hebben we deze krachtige methode op het endogene ingezet
p53-eiwit via de CRISPR-Cas9-technologie. Dit gaf een ongekend en nauwkeurig beeld
het p53-complex dat kennis van deze complexen naar een nieuw detailniveau zal duwen. In deze
project willen we het endogene p53-complex onderzoeken wanneer we de mutaties introduceren
komen voor bij (colonkanker) patiënten. Daarnaast zullen we deze nieuwe tool gebruiken om het effect van te beoordelen
kandidaat-p53-geneesmiddelen op het complex.