Evolutionaire dynamiek van virale pathogenen en de relatie met ziekteprogressie.

RNA virussen worden gekenmerkt door extreme genetische variabiliteit zowel binnen een gastheer als tussen verschillende gastheren. Deze evolutionaire flexibiliteit laat deze virussen toe om zich snel aan te passen aan veranderende omgevingsinvloeden. Krachtige selectieve druk die wordt uitgeoefend door antivirale therapie of door het immuunsysteem heeft een sterke invloed op de evolutionaire dynamiek van het virus binnen de gastheer. Bijgevolg wordt de diversiteit van de virale populatie gevormd door mutaties die worden gefixeerd ten gevolge van de slectieve druk op het virus. De snelheid waarbij RNA virussen genetische veranderingen accumuleren in een populatie en waarbij ziekteprogressie verloopt wordt bepaald door virale en humae factoren evenals interacties tussen beiden. In dit project gaan we de rol van intra-patiënt virale evolutie en adaptief vermogen onderzoeken in relatie met veranderingen in immuunrespons, therapeutische interventie en ziekteprogressie. In een verdere stap zullen we de impact van deze processen op virus diversiteit bestuderen op het niveau van de humane populatie, door veranderingen in mutatiepatronen en in consensus sequentie over tijd te modelleren. Hiervoor worden data mining methoden toegepast of sequentie data, die verscheidene gebieden van het virale genoom met hoge resolutie omvatten, aangevuld met informatie over klinische en immunologische waarden. Waar het onderzoek zich initieel zal toeleggen op HIV-1, zullen we later ook andere RNA virussen bestuderen.

Trefwoorden:HIV-1, Virus, Evolution, Transmission, Fitness, Disease, Data mining

Disciplines:Laboratoriumgeneeskunde, Palliatieve zorg en zorg rond het levenseinde, Regeneratieve geneeskunde, Andere basiswetenschappen, Andere gezondheidswetenschappen, Verpleegkunde, Andere paramedische wetenschappen, Andere translationele wetenschappen, Andere medische en gezondheidswetenschappen