Evaluatie van moleculaire point-of-care Xpert® Xpress SARS-CoV-2-detectie in settings met beperkte middelen (EXPERT-CoV2).

Achtergrond. Snelle diagnostische tests van personen die besmet zijn met het severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is het cornest om vroegtijdige opsporing van gevallen, tracering van contacten en isolatie uit te voeren als onderdeel van de beheersing en de controle van de verspreiding van het dodelijke virus. De huidige diagnostische strategie die wordt aanbevolen om COVID-19-verdachten te identificeren is het opsporen van de aanwezigheid van viraal RNA voor SARS-CoV-2 in luchtwegmonsters met behulp van moleculaire tests zoals SARS-CoV-2-specifieke realtime polymerasekettingreactie (RT-PCR). In veel landen waar de middelen beperkt zijn, zijn de diagnosefaciliteiten echter beperkt en is de toegang tot moleculaire tests (RT-PCR) een uitdaging. Dergelijke tests worden gewoonlijk uitgevoerd in gecentraliseerde laboratoria die ook te kampen hebben met een acuut tekort aan gekwalificeerd laboratoriumpersoneel, een onbetrouwbaar en zwak transportnetwerk voor patiënten en specimens, en inefficiënte systemen voor het afleveren van resultaten. De recente ontwikkeling van de Gene Expert moleculaire Point-of-Care (POC) (Xpert Xpress SARS-CoV-2-test , Cepheid) voor SARS-CoV-2-tests in de kliniek met resultaten die binnen enkele uren na de monsterafname worden afgeleverd, is van vitaal belang geweest om de omlooptijd (TAT) op te lossen. De test is een geautomatiseerde POC voor de kwalitatieve detectie van SARS-CoV-2 in nasofarynxswab, neusspoeling of aspiraatmonsters van verdachte patiënten. GeneXpert wordt op grote schaal uitgerold binnen nationale tuberculose- (TB) en HIV-programma's over het hele continent. De evaluatie van de diagnostische nauwkeurigheid van de onlangs geïntroduceerde Gene Expert moleculaire POC SARS-CoV-2-tests en de haalbaarheid van de integratie daarvan in het TB/HIV-programma zijn echter niet geëvalueerd in omgevingen waar de middelen beperkt zijn. Verwacht wordt dat de aanwezigheid van het Gene Expert-platform en de invoering van SARS-CoV-2-detectie zullen zorgen voor de tijdige opsporing van COVID-19-gevallen, dodelijke slachtoffers zullen voorkomen, de beheersing van de ziekte zullen vergemakkelijken en de belasting van de nationale referentielaboratoria zullen verminderen. Doel van de studie. Deze studie heeft tot doel de diagnostische nauwkeurigheid en doeltreffendheid van POC VL te evalueren bij het verbeteren van de beschikbaarheid van SARS-CoV-2 detectie voor het beheer van COVID-19 patiënten in gedecentraliseerde gezondheidsfaciliteiten in een resource-arresteerde omgeving in Afrika. Bovendien zullen we genomics-surveillance van SARS-CoV-2 en andere respiratoire virussen implementeren om transmissie, evolutie en geofafische verspreiding op te helderen en pandemiebeheersingsinspanningen en beleidsmakers op lokaal en regionaal niveau te informeren. Relevantie. De snelle verspreiding van SAR-CoV-2 maakt een dringende verbetering van de testcapaciteit in gedecentraliseerde gezondheidsfaciliteiten in de regio noodzakelijk. De recente vooruitgang op het gebied van in-vitrodiagnostiek (IVD) met behulp van Xpert Xpress SARS-CoV-2 (Cepheid) biedt mogelijkheden om de diagnostiek in de regio uit te breiden en te verbeteren ter ondersteuning van het patiëntenbeheer en de responsstrategieën om de verspreiding van SARS-CoV-2 tegen te gaan. Een snelle evaluatie en inzet van dit instrument zal dan ook bijdragen tot de beheersing van de overdracht van SARS-CoV-2 onder de bevolking.

Trefwoorden:COVID-19, DIAGNOSTISCHE PROEVEN, VIRALE ETIOLOGIE

Disciplines:Analyse van next-generation sequence data, Infectieziekten, Epidemiologie, Tropische geneeskunde