Deep Sequencing van myeline-reactieve T-cellen om nieuwe ziektemechanismen op te helderen en correlaten te identificeren voor de respons op de behandeling

Terwijl antigeenspecifieke activering van autoreactieve T-cellen essentieel wordt geacht in de initiatie en onderhoud van MS, hoe het brede repertoire van unieke receptoren die door deze tot expressie worden gebracht te identificeren? autoreactieve T-cellen uit bloed blijft onduidelijk. Niettemin, met verbeterde T-celreceptor (TCR)-sequencing technologische ontwikkeling, inspanningen bij het identificeren van immuun-T-celsignaturen in bloed, CSF en hersenlaesies van MS-patiënten zijn gestart. Hoewel de TCR-klonale expansie nauwkeurig wordt geëvalueerd met behulp van hoge doorvoer sequencing in bulk DNA/RNA is een uitdaging geweest, single-cell sequencing maakt het mogelijk om TCR . vast te stellen repertoires van autoreactieve T-cellen op cel-voor-cel basis, verkrijg V(D)J-sequenties van volledige lengte, paar α en β sequenties en combineren TCR met 5'-transcriptoomsequencing in dezelfde cellen, en dit voor duizenden cellen. De gecombineerde expertise van ons interuniversitair team in immunologie en karakterisering van autoreactieve T-cellen (N. Cools, U Antwerpen) enerzijds en in genetica en single-cell sequencing (A. Goris, KU Leuven) de andere maakt het nu haalbaar, actueel en innovatief om de pathogene kenmerken van te onderzoeken autoreactieve T-cellen bij MS. Hiervoor zijn de volgende drie doelen gesteld: 1. Wat is het TCR-repertoire van autoreactieve T-cellen bij MS? 2. Wat zijn de transcriptionele kenmerken van autoreactieve T-cellen? 3. Kan het autoreactieve T-cel-klonotype-repertoire worden gebruikt als correlaat voor therapiereactiviteit?

Trefwoorden:T CELL DEELVERZAMELINGEN, TCR SEQUENCING, MULTIPELE SCLEROSE

Disciplines:Cel-, weefsel- en orgaan engineering, DNA-analysetechnologie, Auto-immuniteit

Project type:Samenwerkingsproject