De rol van ZEB transcriptiefactoren in epigenetische chromatine veranderingen en gen-expressie regulatie tijdens EMT (G050217N)

  Epitheliale naar mesenchymale transitie (EMT) is een proces dat leidt tot een reversibele overgang van een gepolariseerde epitheliale fenotype een beweeglijke en mesenchymale fenotype. EMT is een essentieel proces bij embryonale ontwikkeling en in het volwassen leven in diverse fysiologische (bijvoorbeeld wondheling) en pathologische processen (bijvoorbeeld fibrose progressie van kanker). In onze onderzoeksgroep richten we ons op de Zinc vinger E-box bindende homeobox (ZEB) familie vertegenwoordigd door ZEB1 en ZEB2. We eerder hebben aangetoond dat ZEB factoren reguleren specifieke cellulaire aspecten van EMT en kan tegengestelde effecten in een weefsel-specifieke wijze te hebben. Echter, Zebs functionele specificiteit nu toe niet goed begrepen. Structureel Zebs bestaan ​​uit twee zeer homologe zinkvinger domeinen die DNA binden met hoge affiniteit die tot genrepressie. Andere eiwitdomeinen lijken meer specifiek voor de verschillende ZEB factoren om te interageren met specifieke epigenetische regulatoren of andere TF. Epigenetica verwijst naar erfelijke veranderingen in de activiteit van genen en expressie die plaatsvinden zonder dat de DNA-sequentie (bijvoorbeeld histon modificatie DNA methylering). Wij zijn van mening dat Zebs functie en specificiteit tijdens EMT bevindt zich in een specifieke interactie met dergelijke epigenetische regulatoren. In dit project willen we de bijzondere rol van ZEB1 en ZEB2 op genregulatie ontrafelen tijdens de EMT proces met een genoomwijde sequencing aanpak en leggen de nadruk op het belang van epigenetische regulatoren en TF-bindende partners voor ZEB-functie.