< Terug naar vorige pagina

Project

De ecologische en evolutionaire gevolgen van bacteriële transmissie in het groenwier Bryopsis plumosa

Biotische interacties tussen eukaryoten en hun geassocieerde bacteriële gemeenschappen zijn zeer algemeen en zijn vaak belangrijk voor de gezondheid van de gastheer. Ondanks de relevantie van dergelijke interacties, begrijpen we de ecologische en evolutionaire consequenties, gelinkt aan het verwerving van symbiont in divers microbioom, nog niet. Gebruikmakend van het groenwier Bryopsis plumosa, zullen we de manier waarop de alg zijn (endo)symbiotische bacteriegemeenschap verwerft,verticaal of horizontaal, koppelen aan de coevolutionaire dynamiek tussen bacterie en hun gastheer. Bacteriële transmissie via de verschillende reproductieve strategieën van Bryopsis zal worden bestudeerd met behulp van 16S amplicon sequencing en fluorescentie in situ hybridisatie. Bovendien zal de mogelijkheid om andere bacteriën te verwerven tijdens het vormen van protoplast, een wondreactie die tegelijkertijd als een propagatiemethode fungeert, worden getest door tijdens dit proces fluorescent gelabelde bacteriën te volgen. De metagenoom-geassembleerde genomen van Bryopsis-geassocieerde bacteriën zullen worden gebruikt om de effecten van selectie en drift op de bacteriën te bestuderen en om de functionele relevantie van deze bacteriën voor de gastheer te identificeren. De ecologische en evolutionaire processen die de interacties binnen dit systeem reguleren zullen worden geïdentificeerd door de eigenschappen van de bacteriële genomen te linken aan de manier waarop bacteriën worden verworven.

Datum:1 okt 2020 →  Heden
Trefwoorden:Zeewier
Disciplines:Mariene ecologie, Microbiomen, Gemeenschapsecologie, Analyse van next-generation sequence data, Moleculaire evolutie