Betere inzichten in de spatiale organizatie van weefsels met behulp van machine learning en spatial transcriptomics

In dit project zullen we nieuwe methoden ontwikkelen om beter de spatiale context binnen weefsels functioneel te gaan karakteriseren. Hierbij beogen we de integratie van single-cell multi-omics (transcriptoom en proteoom), spatiale transcriptoomdata en confocale microscopie. Nieuwe machine learning technieken zullen ontwikkeld worden om de hoge spatiale resolutie van microscopie-technieken te combineren met de diepe phenotyperingscapaciteiten van huidige single-cell omics methoden.