Organisatie
Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven)
Division
Het onderzoek in het Laboratorium voor Computational Biology is gericht op gen- en genoom regulatie, met toepassingen in Drosophila en kanker, en op 'integrative genomics', de ontwikkeling van computationele methoden voor genomische data integratie en analyse van 'next-generation sequence data'.
Projecten
41 - 50 of 64
- Ontrafeling van genregulerende netwerken met enkele cel in DrosophilaVanaf10 mei 2017 → 30 sep 2018Financiering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Ontcijfering van het genetisch programma van epitheelcellenVanaf1 jan 2017 → 31 dec 2020Financiering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Het ontcijferen van de regulerende code die ten grondslag ligt van een gemeenschappelijke epigenomische survival-schakelaar bij kanker.Vanaf1 jan 2017 → 31 dec 2020Financiering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- Enhancer logica en transcriptionele regulatie exploiteren om fenotype switching in melanomen te sturenVanaf1 okt 2016 → 14 dec 2020Financiering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs, Privé-financiering van binnenlandse oorsprong - onbepaald
- Biocomputationele wetenschappen op petabyte schaal.Vanaf1 okt 2016 → 30 sep 2018Financiering: Fonds Recuperatie Fiscale Vrijstelling
- Regulerende genomics van cel-differentiatie en kanker cel subpopulaties komende uit hetzelfde weefsel.Vanaf1 okt 2014 → 11 jun 2021Financiering: IWT persoonsgebonden financ. - strategische onderzoeksbeurzen
- Identificatie van cis-regulatorische variatie in kankergenomen aan de hand van een allograft screen in Drosophila.Vanaf1 jan 2014 → 31 dec 2017Financiering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Gebruik van differentiatie van fotoreceptoren in Drosophila als modelsysteem om te ontcijferen hoe een ontwikkelingsprogramma gecodeerd wordt in een dierlijk digenoom.Vanaf1 okt 2013 → 30 sep 2017Financiering: BOF - Geconcert. Onderzoeksacties vanaf 1994
- Drosophila allograft screening om cis-regulerende variatie in kankergenomen te identificeren.Vanaf1 okt 2013 → 9 mei 2018Financiering: IWT persoonsgebonden financ. - strategische onderzoeksbeurzen
- Identificatie van kankermutaties in het niet-coderende genoom.Vanaf1 jan 2013 → 31 dec 2016Financiering: Privé-financiering van binnenlandse oorsprong - onbepaald
Publicaties
1 - 10 van 177
- HIGH-THROUGHPUT SEQUENCING OF THE HUMAN HEPATIC PROGENITOR CELL NICHE REVEALS DIFFERENT SIGNALLING PATHWAYS DEPENDING ON THE UNDERLYING CHRONIC LIVER DISEASE(2015)
Auteurs: Olivier Govaere, Jasper Wouters, Wouter Van Delm, R van Eijsden, An Ceulemans, Werner Van Steenbergen, Diethard Monbaliu, Frederik Nevens, Tania Roskams
Pagina's: S239 - S239 - Combined Proteomics and Transcriptomics Identifies Carboxypeptidase B1 and Nuclear Factor κB (NF-κB) Associated Proteins as Putative Biomarkers of Metastasis in Low Grade Breast Cancer(2015)
Auteurs: Hana Imrichova
Pagina's: 1814 - 1830 - The protein phosphatase 2A regulatory subunit PR70 is a gonosomal melanoma tumor suppressor gene(2016)
Auteurs: Jasper Wouters, Joost van den Oord
- Low expression of pro-apoptotic proteins Bax, Bak and Smac indicates prolonged progression-free survival in chemotherapy-treated metastatic melanoma(2020)
Auteurs: Jasper Wouters, Joost van den Oord
- Cancer stem cells in cutaneous melanoma(2009)
Auteurs: Jasper Wouters, Joost van den Oord, Hugo Vankelecom
Pagina's: 225 - 235 - Evidence for DNA-Binding Domain-Ligand-Binding Domain Communications in the Androgen Receptor(2012)
Auteurs: Christine Helsen, Vanessa Dubois, Annelien Verfaillie, Marc De Maeyer, Frank Claessens
Pagina's: 3033 - 3043 - CD45 antigen negativity in T-lineage ALL correlates with PTPRC mutation and sensitivity to a selective JAK inhibitor(2015)
Auteurs: Stein Aerts, Ellen Geerdens, Jan Cools
Pagina's: 884 - 7 - Plasma cells in primary melanoma. Prognostic significance and possible role of IgA(2016)
Auteurs: Francesca Bosisio, Jasper Wouters, Marguerite Stas, Joost van den Oord
Pagina's: 347 - 58 - BNIP3 promotes HIF-1α-driven melanoma growth by curbing intracellular iron homeostasis(2021)
Auteurs: Matteo Rossi, Chris Van den Haute, Maria Livia Sassano, Abhishek Garg, Francesca Bosisio, Jasper Wouters, Peter Vangheluwe, Wim Annaert, Johan Swinnen, Joost van den Oord, et al.
- A Functional In Situ Approach to TILs in Melanoma: A Critique on the Current Morphological Classification(2016)
Auteurs: Francesca Bosisio, Jasper Wouters, Nathalie Volders, Marguerite Stas, Joost van den Oord
Pagina's: 126A - 126A