Organisatie
Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven)
Division
Het onderzoek in het Laboratorium voor Computational Biology is gericht op gen- en genoom regulatie, met toepassingen in Drosophila en kanker, en op 'integrative genomics', de ontwikkeling van computationele methoden voor genomische data integratie en analyse van 'next-generation sequence data'.
Huidige onderzoekers
11 - 20 of 21 results
- Eren Can Eksi (Lid)
- Nikolai Hecker (Lid)
- Jasper Janssens (Lid)
- Niklas Kempynck (Lid)
- Vasilis Konstantakos (Lid)
- David Mauduit (Lid)
- Alexandra Pančíková (Lid)
- Gabriele Partel (Lid)
- Olga Sigalova (Lid)
- Ibrahim Ihsan Taskiran (Lid)
Projecten
11 - 20 of 64
- Ontrafelen van genregulatie Drosophila melanogaster: naar een regulatiemap in één-cel resolutieVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Ontcijferen van gen-regulatorische netwerken in de era van single-cell multi-omicsVanaf1 sep 2022 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Modellering van genregulatie met end-to-end deep learning van genexpressie-voorspellingenVanaf1 sep 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Integratie van lange read en unieke cell multi-omics sequenering voor de identificatie van genetische variatie in de ziekte van ParkinsonVanaf1 sep 2022 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Rebus EsperVanaf29 jun 2022 → HedenFinanciering: Andere fed. wetenschappelijke instellingen.
- Geavanceerde infrastructuur voor de fabricage van de volgende generatie micro- and nanosystemenVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Het decoderen van de impact van intercellulaire communicatie op de identiteit van tumortoestanden bij epitheliale kankersVanaf1 jan 2022 → HedenFinanciering: FWO EOS
- Het ontrafelen van de regulerende code die de vorming van neurale circuits dirigeertVanaf5 okt 2021 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Single-cell deep learning en comparatieve genoomanalyse voor het in kaart brengen van genregulatorische netwerken en enhancerstructurenVanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: FWO senior postdoctoraal mandaat
- OncoAI - een machine-learning raamwerk om de kwetsbaarheid van kankercellen op genregulerend niveau te voorspellenVanaf1 mrt 2021 → HedenFinanciering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
Publicaties
1 - 10 van 175
- Identification of Circulating Fibrocytes and Dendritic Derivatives in Corneal Endothelium of Patients With Fuchs' Dystrophy(2017)
Auteurs: An-Katrien De Roo, Jasper Wouters, Olivier Govaere, Beatrijs Foets, Joost van den Oord
Pagina's: 670 - 681 - CNKSR1 gene defect can cause syndromic autosomal recessive intellectual disability.(2018)
Auteurs: Ibrahim Ihsan Taskiran
Pagina's: 691 - 699 - Recurrent rearrangements of FOS and FOSB define osteoblastoma(2018)
Auteurs: Annelien Verfaillie, Jonas Demeulemeester, Peter Van Loo
- Gene losses in the common vampire bat illuminate molecular adaptations to blood feeding(2022)
Auteurs: Nikolai Hecker
- Cell type diversity in a developing octopus brain(2022)
Auteurs: Ruth Styfhals, Katina Spanier, Ali Murat ELAGOZ, Seppe De Winter, Astrid Deryckere, Stein Aerts, Eve Seuntjens
- iRegulon: From a Gene List to a Gene Regulatory Network Using Large Motif and Track Collections(2014)
Auteurs: Annelien Verfaillie, Hana Imrichova, Bram Van de Sande, Laura Standaert, Marina Naval Sanchez, Delphine Potier, Dmitry Svetlichnyy, Zeynep Kalender Atak, Mark Fiers, Chris Marine, et al.
- Male-Specific Fruitless Isoforms Target Neurodevelopmental Genes to Specify a Sexually Dimorphic Nervous System(2014)
Auteurs: Bram Van de Sande, Stein Aerts
Pagina's: 229 - 241 - Decoding the regulatory landscape of melanoma reveals TEADS as regulators of the invasive cell state(2015)
Auteurs: Annelien Verfaillie, Hana Imrichova, Zeynep Kalender Atak, Michael Dewaele, Valerie Christiaens, Dmitry Svetlichnyy, Flavie Luciani, Laura Van den Mooter, Sofie Claerhout, Mark Fiers, et al.
- EXPLORING THE CODE OF LIFE: FROM DECODING TO DESIGNING CELL TYPE-SPECIFIC ENHANCERS WITH DEEP LEARNING(2023)
Auteurs: Ibrahim Ihsan Taskiran, Stein Aerts
- Adult interfollicular tumour-initiating cells are reprogrammed into an embryonic hair follicle progenitor-like fate during basal cell carcinoma initiation(2012)
Auteurs: Bram Van de Sande, Stein Aerts
Pagina's: 1282 - 1294