Organisatie
Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven)
Division
Het onderzoek in het Laboratorium voor Computational Biology is gericht op gen- en genoom regulatie, met toepassingen in Drosophila en kanker, en op 'integrative genomics', de ontwikkeling van computationele methoden voor genomische data integratie en analyse van 'next-generation sequence data'.
Huidige onderzoekers
1 - 10 of 21 results
- Stein Aerts (Verantwoordelijke)
- Darina Abaffyová (Lid)
- Stein Aerts (Lid)
- Sara Aibar Santos (Lid)
- Cas Blaauw (Lid)
- Carmen Bravo González-Blas (Lid)
- Florian De Rop (Lid)
- Seppe De Winter (Lid)
- Hannah Dickmänken (Lid)
- Sam Dieltiens (Lid)
Projecten
1 - 10 of 64
- Genregulatie begrijpen in een heel dier: Van het bouwen van een regulatie-atlas tot het decoderen van genregulatie met deep learningVanaf10 jan 2024 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SpaceTimeOmics: combinatie van hogedoorvoer spatial omics met AI om generegulatie te modeleren in een organisme doorheen de tijdVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Interpretatie van genomische regulatorische variatie in de menselijke hersenen en de ziekte van Parkinson, door integratie van deep learning en single-cell multi-omicsVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Deep learning gebaseerd synthetisch ontwerp en massaal parallelle reporterassays om celtype- specifieke enhancer te karakteriseren en te benuttenVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Enhancer-AI: AI-gestuurde modellering en ontwerp van celtype-specifieke versterkers voor gentherapieVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategisch Basisonderzoek (SBO)
- Deep learning oplossingen voor het ontcijferen van genregulatie in het menselijk breinVanaf7 mrt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- De rol van door smORF gecodeerde polypeptiden bij lagere bierfermentatieVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Toepassingen van deep learning voor kankergenomicaVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Evolutie van de genomische regulatorische code die ten grondslag ligt aan neuronale diversiteitVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SymBioSys: Analyse van de genomische heterogeneïteit via de computationele analyse van lange DNA fragmentenVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: BOF - projecten
Publicaties
1 - 10 van 177
- Mass Spectrometry of Flame Figures(2015)
Auteurs: Jasper Wouters, Etienne Waelkens, Siegfried Segaert, Joost van den Oord
Pagina's: 734 - 735 - First-in-Human Proof-of-Concept Study: Intralesional Administration of BQ788, an Endothelin Receptor B Antagonist, to Melanoma Skin Metastases(2015)
Auteurs: Jasper Wouters, Joost van den Oord
Pagina's: 1121 - 1122 - Prognostic and predictive biomarkers in melanoma: an update(2016)
Auteurs: Jasper Wouters
Pagina's: 223 - 237 - Laminin-332 sustains chemoresistance and quiescence as part of the human hepatic cancer stem cell niche(2016)
Auteurs: Olivier Govaere, Jasper Wouters, An Ceulemans, Frederik Nevens, Baki Topal, Hugo Vankelecom, Tania Roskams
Pagina's: 609 - 17 - KERATIN 19: A KEY ROLE PLAYER IN THE INVASION OF HUMAN HEPATOCELLULAR CARCINOMAS(2013)
Auteurs: Olivier Govaere, MIna Komuta, Joost Berkers, B Spee, Carl Janssen, F de Luca, A Katoonizadeh, Jasper Wouters, LC van Kempen, A Durnez, et al.
Pagina's: S430 - S430 - Keratin 19: a key role player in the invasion of human hepatocellular carcinomas(2014)
Auteurs: Olivier Govaere, MIna Komuta, Joost Berkers, Bart Spee, Carl Janssen, Francesca de Luca, Aezam Katoonizadeh, Jasper Wouters, Léon C van Kempen, Anne Durnez, et al.
Pagina's: 674 - 685 - Human pancreatic cancer contains a side population expressing cancer stem cell-associated and prognostic genes(2013)
Auteurs: Hugo Vankelecom, Wouter Van Delm, Jasper Wouters, Olivier Govaere, Tania Roskams, Baki Topal
- Macrophage scavenger receptor 1 mediates lipid-induced inflammation in non-alcoholic fatty liver disease(2022)
Auteurs: Olivier Govaere, Jasper Wouters, Matthias Van Haele, Baki Topal, Tania Roskams
Pagina's: 1001 - 1012 - A novel hypoxia-associated subset of FN1(high)MITF(low) melanoma cells: identification, characterization, and prognostic value(2014)
Auteurs: Jasper Wouters, Marguerite Stas, Olivier Govaere, Kathleen Barrette, Hugo Vankelecom, Joost van den Oord
Pagina's: 1088 - 1100 - Vision-related convergent gene losses reveal SERPINE3's unknown role in the eye(2022)
Auteurs: Nikolai Hecker