Onderzoeker
Yvan Saeys
- Trefwoorden (Ghent University):single cell bioinformatics, machine learning
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Analyse van next-generation sequence data, Adaptieve immunologie, Bacteriologie
- Disciplines (Ghent University):Machine learning en besluitvorming, Gezondheidsinformatica, Single-cell data analyse, Datamining, Computationele biomodellering en machine learning, Bioinformatica, Computerwetenschappen
- Zie ook: Yvan Saeys (Vlaams Instituut voor Biotechnologie)
Affiliaties
- Vakgroep Toegepaste Wiskunde, Informatica en Statistiek (Departement)
Lid
Vanaf1 feb 2017 → Heden - Saeys Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2017 → Heden - Vakgroep Inwendige ziekten (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2013 → 31 jan 2017 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf15 jan 2001 → 30 sep 2013
Projecten
1 - 10 of 38
- Single-cell SPACEVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Computationele cytometrie-technieken voor klinische toepassingen.Vanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: FWO senior postdoctoraal mandaat
- SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele celVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Het decoderen van de impact van intercellulaire communicatie op de identiteit van tumortoestanden bij epitheliale kankersVanaf1 jan 2022 → HedenFinanciering: FWO EOS
- Interpreteerbare modellen voor de integratieve analyse van single-cell spatiale transcriptoom dataVanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Aligneren van patient-specifieken cellontwikkelingstrajectenVanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Het ontrafelen van de rol van nucleaire receptor HNF4a in sepsis, alsook de mechanismen van zijn functieverlies in relatie tot het falen van PPARa.Vanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Klinische toepassingen van de computationele cytometrieVanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: BOF - postdoctorale mandaten
- Intercellulaire communicatie in tijd en ruimteVanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Onderzoek naar de immunologie van irreversibele luchtwegvernauwing bij astmaVanaf1 jan 2021 → HedenFinanciering: BOF - Methusalem
Publicaties
41 - 50 van 226
- Data processing workflow for large-scale immune monitoring studies by mass cytometry(2021)
Auteurs: Paulina Rybakowska, Sofie Van Gassen, Katrien Quintelier, Yvan Saeys, Marta E. Alarcón-Riquelme, Concepción Marañón
Pagina's: 3160 - 3175 - Maize specialized metabolome networks reveal organ-preferential mixed glycosides(2021)
Auteurs: Sandrien Desmet, Yvan Saeys, Kevin Verstaen, Rebecca Dauwe, Hoon Kim, Claudiu Niculaes, Atsushi Fukushima, Geert Goeminne, Ruben Vanholme, John Ralph, et al.
Pagina's: 1127 - 1144 - Advances and opportunities in single-cell transcriptomics for plant research(2021)
Auteurs: Carolin Seyfferth, Jim Renema, Jos Wendrich, Thomas Eekhout, Niels Vandamme, Bernhard Blob, Yvan Saeys, Yrjo Helariutta, Kenneth D. Birnbaum, Bert De Rybel
Pagina's: 847 - 866 - Macrophages are metabolically heterogeneous within the tumor microenvironment(2021)
Auteurs: Xenia Geeraerts, Juan Fernandez-Garcia, Felix J. Hartmann, Kyra E. de Goede, Liesbet Martens, Yvon Elkrim, Ayla Debraekeleer, Benoit Stijlemans, Anke Vandekeere, Gianmarco Rinaldi, et al.
- Monocyte-driven atypical cytokine storm and aberrant neutrophil activation as key mediators of COVID-19 disease severity(2021)
Auteurs: L. Vanderbeke, P. Van Mol, Y. Van Herck, F. De Smet, S. Humblet-Baron, K. Martinod, A. Antoranz, I. Arijs, B. Boeckx, F. M. Bosisio, et al.
- ILC3s control splenic cDC homeostasis via lymphotoxin signaling(2021)
Auteurs: Matthias Vanderkerken, Antonio Pires da Silva Baptista, Marco De Giovanni, Satoshi Fukuyama, Charlotte Scott, Paula S. Norris, Gerard Eberl, James P. Di Santo, Eric Vivier, Yvan Saeys, et al.
- Fibrotic enzymes modulate wound-induced skin tumorigenesis(2021)
Auteurs: Lisette Van Hove, Kim Lecomte, Niels Vandamme, Hanna-Kaisa Vikkula, Isabelle Hoorens, Tino Hochepied, Giacomo Donati, Yvan Saeys, Sven R. Quist, Fiona M. Watt, et al.
- A20 deficiency in myeloid cells protects mice from diet-induced obesity and insulin resistance due to increased fatty acid metabolism(2021)
Auteurs: Leen Catrysse, Bastiaan Maes, Parul Mehrotra, Arne Martens, Esther Hoste, Liesbet Martens, Christian Maueröder, Anneleen Remmerie, Anna Bujko, Karolina Slowicka, et al.
- Immune monitoring in melanoma and urothelial cancer patients treated with anti-PD-1 immunotherapy and SBRT discloses tumor specific immune signatures(2021)
Auteurs: Annabel Meireson, Simon Tavernier, Sofie Van Gassen, Nora Sundahl, Annelies Demeyer, Mathieu Spaas, Vibeke Kruse, Liesbeth Ferdinande, Jo Van Dorpe, Benjamin Hennart, et al.
- SCMFTS : scalable and distributed complexity measures and features for univariate and multivariate time series in Big Data environments(2021)
Auteurs: Francisco J. Baldan, Daniel Peralta Cámara, Yvan Saeys, Jose M. Benitez