Onderzoeker
Yvan Saeys
- Trefwoorden (Ghent University):single cell bioinformatics, machine learning
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Analyse van next-generation sequence data, Adaptieve immunologie, Bacteriologie
- Disciplines (Ghent University):Machine learning en besluitvorming, Gezondheidsinformatica, Single-cell data analyse, Datamining, Computationele biomodellering en machine learning, Bioinformatica, Computerwetenschappen
- Zie ook: Yvan Saeys (Vlaams Instituut voor Biotechnologie)
Affiliaties
- Vakgroep Toegepaste Wiskunde, Informatica en Statistiek (Departement)
Lid
Vanaf1 feb 2017 → Heden - Saeys Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2017 → Heden - Vakgroep Inwendige ziekten (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2013 → 31 jan 2017 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf15 jan 2001 → 30 sep 2013
Projecten
1 - 10 of 38
- Single-cell SPACEVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Computationele cytometrie-technieken voor klinische toepassingen.Vanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: FWO senior postdoctoraal mandaat
- SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele celVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Het decoderen van de impact van intercellulaire communicatie op de identiteit van tumortoestanden bij epitheliale kankersVanaf1 jan 2022 → HedenFinanciering: FWO EOS
- Interpreteerbare modellen voor de integratieve analyse van single-cell spatiale transcriptoom dataVanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Aligneren van patient-specifieken cellontwikkelingstrajectenVanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Het ontrafelen van de rol van nucleaire receptor HNF4a in sepsis, alsook de mechanismen van zijn functieverlies in relatie tot het falen van PPARa.Vanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Klinische toepassingen van de computationele cytometrieVanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: BOF - postdoctorale mandaten
- Intercellulaire communicatie in tijd en ruimteVanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Onderzoek naar de immunologie van irreversibele luchtwegvernauwing bij astmaVanaf1 jan 2021 → HedenFinanciering: BOF - Methusalem
Publicaties
21 - 30 van 226
- Distinct transcriptional programs in ascitic and solid cancer cells induce different responses to chemotherapy in high-grade serous ovarian cancer(2022)
Auteurs: Nele Loret, Niels Vandamme, Joachim Taminau, Kato De Clercq, Sven Jonckheere, Kelly Lemeire, Sofie De Prijck, Kevin Verstaen, Steven Weyers, Hannelore Denys, et al.
Pagina's: 1532 - 1547 - PDD-SHAP: Fast Approximations for Shapley Values using Functional Decomposition(2022)
Auteurs: Arne Gevaert, Yvan Saeys
Aantal pagina's: 1 - Angiogenesis goes computational : the future way forward to discover new angiogenic targets?(2022)
Auteurs: Abhishek Subramanian, Pooya Zakeri, Mira Mousa, Halima Alnaqbi, Fatima Yousif Alshamsi, Leo Bettoni, Ernesto Damiani, Habiba Alsafar, Yvan Saeys, Peter Carmeliet
Pagina's: 5235 - 5255 - The curse revisited : when are distances informative for the ground truth in noisy high-dimensional data?(2022)Volume: 151
Auteurs: Robin Vandaele, Bo Kang, Tijl De Bie, Yvan Saeys, G Camps-Valls
Aantal pagina's: 1 - Spatial proteogenomics reveals distinct and evolutionarily conserved hepatic macrophage niches(2022)
Auteurs: Martin Guilliams, Johnny Bonnardel, Birthe Haest, Bart Vanderborght, Camille Wagner, Anneleen Remmerie, Anna Bujko, Liesbet Martens, Tinne Thoné, Federico Francesco De Ponti, et al.
Pagina's: 379 - 396 - A machine learning pipeline for prediction of bone marrow oedema along the sacroiliac joints on magnetic resonance imaging(2022)
Auteurs: Joris Roels, Ann-Sophie De Craemer, Thomas Renson, Manouk de Hooge, Arne Gevaert, Lennart Jans, Nele Herregods, Thomas Van Den Berghe, Philippe Carron, Filip Van den Bosch, et al.
Pagina's: 12 - 12 - A cellular hierarchy in melanoma uncouples growth and metastasis(2022)
Auteurs: Panagiotis Karras, Ignacio Bordeu, Joanna Pozniak, Ada Nowosad, Cecilia Pazzi, Nina Van Raemdonck, Ewout Landeloos, Yannick Van Herck, Dennis Pedri, Greet Bervoets, et al.
Pagina's: 190 - 198 - Single-cell RNA and protein profiling of immune cells from the mouse brain and its border tissues(2022)
Auteurs: Isabelle Scheyltjens, Hannah Van Hove, Karen De Vlaminck, Daliya Kancheva, Jonathan Bastos, Monica Vara-Perez, Ana Rita Pombo Antunes, Liesbet Martens, Charlotte Scott, Jo Van Ginderachter, et al.
Pagina's: 2354 - 2388 - PeacoQC : peak-based selection of high quality cytometry data(2022)
Auteurs: Annelies Emmaneel, Katrien Quintelier, Dorine Sichien, Paulina Rybakowska, Concepcion Maranon, Marta E. Alarcon-Riquelme, Gert Van Isterdael, Sofie Van Gassen, Yvan Saeys
Pagina's: 325 - 338 - TIM3+ TRBV11-2 T cells and IFNγ signature in patrolling monocytes and CD16+ NK cells delineate MIS-C(2022)
Auteurs: Levi Hoste, Lisa Roels, Leslie Naesens, Victor Bosteels, Stijn Vanhee, Sam Dupont, Cédric Bosteels, Robin Browaeys, Niels Vandamme, Kevin Verstaen, et al.