Onderzoeker
Yvan Saeys
- Trefwoorden:single cell bioinformatics, machine learning
- Disciplines:Machine learning en besluitvorming, Gezondheidsinformatica, Single-cell data analyse, Datamining, Computationele biomodellering en machine learning, Bioinformatica, Computerwetenschappen
Affiliaties
- Vakgroep Toegepaste Wiskunde, Informatica en Statistiek (Departement)
Lid
Vanaf1 feb 2017 → Heden - Vakgroep Inwendige ziekten (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2013 → 31 jan 2017 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf15 jan 2001 → 30 sep 2013
Projecten
1 - 10 of 23 results
- Onderzoek naar de immunologie van irreversibele luchtwegvernauwing bij astmaVanaf1 jan 2021 → HedenFinanciering: BOF - Methusalem
- Betere inzichten in de spatiale organizatie van weefsels met behulp van machine learning en spatial transcriptomicsVanaf1 nov 2020 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Een kwantitatieve vergelijking van deep learning technieken voor exploratieve en gesuperviseerde analyse van hoog-dimensionale cytometrie-dataVanaf1 nov 2020 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- U+2018Immunodeficiënties ten gevolge van IKAROS mutaties in het felle zonlichtU+2019,
een gedetailleerde studie die het genetische en immunologische spectrum van IKAROS-gemedieerde immuunstoornissen in kaart brengt.Vanaf1 nov 2020 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Covid-Track: toepassing van kwantitatieve virologie en single cell genomics om de interacties tussen virus en gastheer te ontrafelen die leiden tot ernstige immunologisch gemedieerde ziekte bij COVID-19-patiëntenVanaf15 apr 2020 → 14 apr 2021Financiering: BOF - projecten
- CONDITIONAL: COvid-19: iNteractie tussen genetische preDispositie en immunologisch fenotypeVanaf15 apr 2020 → 14 apr 2021Financiering: BOF - projecten
- Een benchmark-gebaseerde kwantificatie van de interpretabiliteit van neurale netwerk gebaseerde methodenVanaf1 jan 2020 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Ontrafelen van de choroid plexus heterogeniteit en de gevolgen ervan op de biologische respons op inflammatie reacties.Vanaf1 nov 2019 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- De ontwikkeling van een humaan pluripotent stamcel-gebaseerd differentiatiemodel om de normale en getransformeerde sympathoadrenale progenitors te bestuderen.Vanaf1 nov 2019 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Een verkennend onderzoek van machine learning technieken voor afbeeldingsflowcytometrie.Vanaf1 jan 2019 → 31 dec 2020Financiering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
Publicaties
1 - 10 of 170 results
- Maize specialized metabolome networks reveal organ-preferential mixed glycosides(2021)
Auteurs: Sandrien Desmet, Yvan Saeys, Kevin Verstaen, Rebecca Dauwe, Hoon Kim, Claudiu Niculaes, Atsushi Fukushima, Geert Goeminne, Ruben Vanholme, John Ralph, et al.
Pagina's: 1127 - 1144 - Advances and opportunities of single-cell transcriptomics for plant research(2021)
Auteurs: Carolin Seyfferth, Jim Renema, Jos Wendrich, Thomas Eekhout, Ruth Seurinck, Niels Vandamme, Bernhard Blob, Yvan Saeys, Yrjo Helariutta, Kenneth D. Birnbaum, et al.
Aantal pagina's: 1 - Graph approximations to geodesics on metric graphs(2021)
Auteurs: Robin Vandaele, Yvan Saeys, Tijl De Bie
Pagina's: 7328 - 7334 - ILC3s control splenic cDC homeostasis via lymphotoxin signaling(2021)
Auteurs: Matthias Vanderkerken, Antonio Pires da Silva Baptista, Marco De Giovanni, Satoshi Fukuyama, Robin Browaeys, Charlotte Scott, Paula S. Norris, Gerard Eberl, James P. Di Santo, Eric Vivier, et al.
Aantal pagina's: 1 - Fibrotic enzymes modulate wound-induced skin tumorigenesis(2021)
Auteurs: Lisette Van Hove, Kim Lecomte, Jana Roels, Niels Vandamme, Hanna-Kaisa Vikkula, Isabelle Hoorens, Katia Ongenae, Tino Hochepied, Giacomo Donati, Yvan Saeys, et al.
Aantal pagina's: 1 - OTULIN prevents liver inflammation and hepatocellular carcinoma by inhibiting FADD- and RIPK1 kinase-mediated hepatocyte apoptosis(2020)
Auteurs: Lien Verboom, Arne Martens, Dario Priem, Esther Hoste, Mozes Sze, Hanna-Kaisa Vikkula, Lisette Van Hove, Sofie Voet, Jana Roels, Jonathan Maelfait, et al.
Pagina's: 2237 - 2247 - Osteopontin expression identifies a subset of recruited macrophages distinct from Kupffer cells in the fatty liver(2020)
Auteurs: Anneleen Remmerie, Liesbet Martens, Tinne Thoné, Angela Castoldi, Ruth Seurinck, Benjamin Pavie, Joris Roels, Bavo Vanneste, Sofie De Prijck, Mathias Vanhockerhout, et al.
Pagina's: 641 - 657.e1U+2013e14 - A cell atlas of human thymic development defines T cell repertoire formation(2020)
Auteurs: Jong-Eun Park, Rachel A. Botting, Cecilia Domínguez Conde, Dorin-Mirel Popescu, Marieke Lavaert, Daniel J. Kunz, Issac Goh, Emily Stephenson, Roberta Ragazzini, Elizabeth Tuck, et al.
Aantal pagina's: 1 - Integrated scRNA-seq identifies human postnatal thymus seeding progenitors and regulatory dynamics of differentiating immature thymocytes(2020)
Auteurs: Marieke Lavaert, Kai Ling Liang, Niels Vandamme, Jong-Eun Park, Juliette Roels, Monica S. Kowalczyk, Bo Li, Orr Ashenberg, Marcin Tabaka, Danielle Dionne, et al.
Pagina's: 1088 - 1104.e6 - An interactive ImageJ plugin for semi-automated image denoising in electron microscopy(2020)
Auteurs: Joris Roels, Frank Vernaillen, Anna Kremer, Amanda Gonçalves, Jan Aelterman, Quang Luong, Bart Goossens, Wilfried Philips, Saskia Lippens, Yvan Saeys
Aantal pagina's: 1