Onderzoeker
Yvan Saeys
- Trefwoorden:single cell bioinformatics, machine learning, Geneeskunde, Wiskunde, Technische en toegepaste scheikunde
- Disciplines:Machine learning en besluitvorming, Gezondheidsinformatica, Single-cell data analyse, Datamining, Computationele biomodellering en machine learning, Bio-informatica, Computerwetenschappen
Affiliaties
- Vakgroep Toegepaste Wiskunde, Informatica en Statistiek (Departement)
Lid
Vanaf1 feb 2017 → Heden - Vakgroep Inwendige ziekten (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2013 → 31 jan 2017 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 jan 2006 → 30 sep 2013
Projecten
1 - 10 of 14 results
- De ontwikkeling van T cel autoreactiviteit in reumatoïde artritis: de U+201Csmoking gunU+201D hypotheseVanaf1 jan 2019 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject
- Een verkennend onderzoek van machine learning technieken voor afbeeldingsflowcytometrie.Vanaf1 jan 2019 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Analyse van grote single-cell datasets met deep learning en parallelle multi-instance algoritmesVanaf1 okt 2018 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Verbeteren van de diagnose en prognose van primaire immuundeficiënties met behulp van computationele flowcytometrieVanaf1 okt 2018 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Een Formele Karakterisatie van de Robuustheid van Diepe Neurale Netwerken tegen Adversarial PerturbationsVanaf1 okt 2018 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- De rol van mucosale integriteit in de pathogenese van spondyloartritisVanaf1 okt 2018 → HedenFinanciering: BOF - Nieuwe Onderzoeksinitiatieven
- Een studie van de heterogeniciteit en dynamiek van normale en abnormale hematopoese met behulp van single-cell bioinformaticaVanaf1 jan 2018 → HedenFinanciering: BOF - Geconcert. Onderzoeksacties vanaf 1994
- Modelleren van intercellulaire signalisatieprocessen tijdens cellulaire differentiatie op basis van transcriptoom data van individuele cellen.Vanaf1 okt 2017 → 30 sep 2019Financiering: FWO mandaten
- Ontrafelen van de regulatorische dynamiek van Kupffer-cel differentiatieVanaf1 okt 2016 → HedenFinanciering: BOF - Nieuwe Onderzoeksinitiatieven
- Ontrafelen van de functionele diversiteit van macrofagen en dendritische cellen met behulp van modulenetwerken en intercellulaire signalisatienetwerken.Vanaf1 okt 2015 → 30 sep 2019Financiering: FWO mandaten
Publicaties
1 - 10 of 133 results
- RORU+03B3t inhibition selectively targets IL-17 producing iNKT and U+03B3U+03B4-T cells enriched in Spondyloarthritis patients(2019)Tijdschrift: Nature CommunicationsVolume: 10
Auteurs: Koen Venken, Peggy Jacques, Céline Mortier, Mark E. Labadia, Tine Decruy, Julie Coudenys, Kathleen Hoyt, Anita L. Wayne, Robert Hughes, Michael Turner, et al.
Aantal pagina's: 1 - A single-cell atlas of mouse brain macrophages reveals unique transcriptional identities shaped by ontogeny and tissue environment(2019)Tijdschrift: Nature NeuroscienceISSN: 1097-6256Issue: 6Volume: 22
Auteurs: Hannah Van Hove, Liesbet Martens, Isabelle Scheyltjens, Karen De Vlaminck, Ana Rita Pombo Antunes, Sofie De Prijck, Niels Vandamme, Sebastiaan De Schepper, Gert Van Isterdael, Charlotte Scott, et al.
Pagina's: 1021 - 1035 - Single-cell RNA sequencing of the T helper cell response to house dust mites defines a distinct gene expression signature in airway Th2 cells(2019)Tijdschrift: IMMUNITYISSN: 1097-4180Issue: 1Volume: 51
Auteurs: Christopher Andrew Tibbitt, Julian Mario Stark, Liesbet Martens, Junjie Ma, Jeff Eron Mold, Kim Deswarte, Ganna Oliynyk, Xiaogang Feng, Bart Lambrecht, Pieter De Bleser, et al.
Pagina's: 169 - 184 - Domain adaptive segmentation in volume electron microscopy imaging(2019)Boek: 2019 IEEE 16th international symposium on biomedical imaging (ISBI 2019)
Auteurs: Joris Roels, Julian Hennies, Yvan Saeys, Wilfried Philips, Anna Kreshuk
Pagina's: 1519 - 1522 - Nlrp3 inflammasome activation and Gasdermin D-driven pyroptosis are immunopathogenic upon gastrointestinal norovirus infection(2019)Tijdschrift: PLoS PathogensISSN: 1553-7366Issue: 4Volume: 15
Auteurs: Hanne Dubois, Frederic Sorgeloos, Soroush T. Sarvestani, Liesbet Martens, Yvan Saeys, Jason M. Mackenzie, Mohamed Lamkanfi, Geert van Loo, Ian Goodfellow, Andy Wullaert
Aantal pagina's: 1 - Computational approaches for high-throughput single-cell data analysis(2019)Tijdschrift: FEBS JOURNALISSN: 1742-4658Issue: 8Volume: 286
Auteurs: Helena Todorov, Yvan Saeys
Pagina's: 1451 - 1467 - A comparison of single-cell trajectory inference methods(2019)Tijdschrift: Nature BiotechnologyISSN: 1087-0156Issue: 5Volume: 37
Auteurs: Wouter Saelens, Robrecht Cannoodt, Helena Todorov, Yvan Saeys
Pagina's: 547 - 554 - Myocarditis elicits dendritic cell and monocyte infiltration in the heart and self-antigen presentation by conventional type 2 dendritic cells(2018)Tijdschrift: Frontiers in ImmunologyVolume: 9
Auteurs: Katrien Van Der Borght, Charlotte Scott, Liesbet Martens, Dorine Sichien, Gert Van Isterdael, Veronika Nindl, Yvan Saeys, Louis Boon, Burkhard Ludewig, Thierry Gillebert, et al.
Aantal pagina's: 1 - Stabilization of cytokine mRNAs in iNKT cells requires the serine-threonine kinase IRE1alpha(2018)Tijdschrift: Nature CommunicationsVolume: 9
Auteurs: Srinath Govindarajan, Djoere Gaublomme, Renée Van der Cruyssen, Eveline Verheugen, Sofie Van Gassen, Yvan Saeys, Simon Tavernier, Takao Iwawaki, Yehudi Bloch, Savvas Savvides, et al.
Aantal pagina's: 1 - IncGraph : incremental graphlet counting for topology optimisation(2018)Tijdschrift: PLOS ONEISSN: 1932-6203Issue: 4Volume: 13
Auteurs: Robrecht Cannoodt, Joeri Ruyssinck, Jana Ramon, Katleen De Preter, Yvan Saeys
Aantal pagina's: 1