Onderzoeker
Yvan Saeys
- Trefwoorden:single cell bioinformatics, machine learning
- Disciplines:Machine learning en besluitvorming, Gezondheidsinformatica, Single-cell data analyse, Datamining, Computationele biomodellering en machine learning, Bio-informatica, Computerwetenschappen
Affiliaties
- Vakgroep Toegepaste Wiskunde, Informatica en Statistiek (Departement)
Lid
Vanaf1 feb 2017 → Heden - Vakgroep Inwendige ziekten (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2013 → 31 jan 2017 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 jan 2006 → 30 sep 2013
Projecten
1 - 10 of 22 results
- Betere inzichten in de spatiale organizatie van weefsels met behulp van machine learning en spatial transcriptomicsVanaf1 nov 2020 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Een kwantitatieve vergelijking van deep learning technieken voor exploratieve en gesuperviseerde analyse van hoog-dimensionale cytometrie-dataVanaf1 nov 2020 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- U+2018Immunodeficiënties ten gevolge van IKAROS mutaties in het felle zonlichtU+2019,een gedetailleerde studie die het genetische en immunologische spectrum van IKAROS-gemedieerde immuunstoornissen in kaart brengt.Vanaf1 nov 2020 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Covid-Track: toepassing van kwantitatieve virologie en single cell genomics om de interacties tussen virus en gastheer te ontrafelen die leiden tot ernstige immunologisch gemedieerde ziekte bij COVID-19-patiëntenVanaf15 apr 2020 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- CONDITIONAL: COvid-19: iNteractie tussen genetische preDispositie en immunologisch fenotypeVanaf15 apr 2020 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Een benchmark-gebaseerde kwantificatie van de interpretabiliteit van neurale netwerk gebaseerde methodenVanaf1 jan 2020 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Ontrafelen van de choroid plexus heterogeniteit en de gevolgen ervan op de biologische respons op inflammatie reacties.Vanaf1 nov 2019 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- De ontwikkeling van een humaan pluripotent stamcel-gebaseerd differentiatiemodel om de normale en getransformeerde sympathoadrenale progenitors te bestuderen.Vanaf1 nov 2019 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Een verkennend onderzoek van machine learning technieken voor afbeeldingsflowcytometrie.Vanaf1 jan 2019 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- De ontwikkeling van T cel autoreactiviteit in reumatoïde artritis: de U+201Csmoking gunU+201D hypotheseVanaf1 jan 2019 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject
Publicaties
1 - 10 of 156 results
- Osteopontin expression identifies a subset of recruited macrophages distinct from Kupffer cells in the fatty liver(2020)
Auteurs: Anneleen Remmerie, Liesbet Martens, Tinne Thoné, Angela Castoldi, Ruth Seurinck, Benjamin Pavie, Joris Roels, Bavo Vanneste, Sofie De Prijck, Mathias Vanhockerhout, et al.
Pagina's: 641 - 657.e1U+2013e14 - A cell atlas of human thymic development defines T cell repertoire formation(2020)
Auteurs: Jong-Eun Park, Rachel A. Botting, Cecilia Domínguez Conde, Dorin-Mirel Popescu, Marieke Lavaert, Daniel J. Kunz, Issac Goh, Emily Stephenson, Roberta Ragazzini, Elizabeth Tuck, et al.
Aantal pagina's: 1 - OTULIN prevents liver inflammation and hepatocellular carcinoma by inhibiting FADD- and RIPK1 kinase-mediated hepatocyte apoptosis(2020)
Auteurs: Lien Verboom, Arne Martens, Dario Priem, Esther Hoste, Mozes Sze, Hanna-Kaisa Vikkula, Lisette Van Hove, Sofie Voet, Jana Roels, Jonathan Maelfait, et al.
Pagina's: 2237 - 2247 - Integrated scRNA-seq identifies human postnatal thymus seeding progenitors and regulatory dynamics of differentiating immature thymocytes(2020)
Auteurs: Marieke Lavaert, Kai Ling Liang, Niels Vandamme, Jong-Eun Park, Juliette Roels, Monica S. Kowalczyk, Bo Li, Orr Ashenberg, Marcin Tabaka, Danielle Dionne, et al.
Pagina's: 1088 - 1104.e6 - An interactive ImageJ plugin for semi-automated image denoising in electron microscopy(2020)
Auteurs: Joris Roels, Frank Vernaillen, Anna Kremer, Amanda Gonçalves, Jan Aelterman, Quang Luong, Bart Goossens, Wilfried Philips, Saskia Lippens, Yvan Saeys
Aantal pagina's: 1 - Robust unsupervised dimensionality reduction based on feature clustering for single-cell imaging data(2020)
Auteurs: Daniel Peralta, Yvan Saeys
Aantal pagina's: 1 - NicheNet : modeling intercellular communication by linking ligands to target genes(2020)
Auteurs: Robin Browaeys, Wouter Saelens, Yvan Saeys
Pagina's: 159 - 162 - Special issue on machine learning for single cell cata(2020)
Auteurs: Yvan Saeys, Greg Finak
Pagina's: 217 - 218 - Trajectory-based differential expression analysis for single-cell sequencing data(2020)
Auteurs: Koen Van den Berge, Hector Roux de Bézieux, Kelly Street, Wouter Saelens, Robrecht Cannoodt, Yvan Saeys, Sandrine Dudoit, Lieven Clement
Aantal pagina's: 1 - Profiling peripheral nerve macrophages reveals two macrophage subsets with distinct localization, transcriptome and response to injury(2020)
Auteurs: Elke Ydens, Lukas Amann, Bob Asselbergh, Charlotte Scott, Liesbet Martens, Dorine Sichien, Omar Mossad, Thomas Blank, Sofie De Prijck, Donovan Low, et al.
Pagina's: 676 - 689