Onderzoeker
Tom Ruttink
- Disciplines:Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Moleculaire en celbiologie niet elders geclassificeerd, Genomics, Celgroei en -ontwikkeling, Microbiomen, Genoomstructuur en -regulatie, Cel- en moleculaire biologie van planten, Andere biotechnologie, bio-en biosysteem ingenieurswetenschappen niet elders geclassificeerd, Computationele evolutionaire biologie, comparatieve genomics en populatiegenomics, Ontwikkelings- en reproductieve biologie van planten, Computationele transcriptomics en epigenomics, Agrarische landbouw en biotechnologie
Affiliaties
- Plant (Onderzoekseenheid)
Lid
Vanaf1 jan 2019 → Heden - Groei en Ontwikkeling (Afdeling)
Lid
Vanaf1 sep 2007 → 31 dec 2018
Projecten
1 - 10 of 14
- Benutten van het potentieel van 'Gene editing' in kader van een duurzame bio-economie.Vanaf1 sep 2022 → Heden
- Creatie van CENH3 haploïd inducer lijnen en transcriptoomstudie van CMS stabiliteit in Cichorium intybusVanaf1 okt 2019 → Heden
- Opbouw van kennis voor het exploiteren van nieuwe tarwetypes rijk aan arabinoxylan voedingsvezels doorheen de ganse tarwe waardeketenVanaf1 sep 2019 → Heden
- Effecten van verstoring van het tropische regenwoud op de uitwisseling van genetisch materiaal, genomische diversiteit en introgressie bij bomen in de onder-etage: Het geval van Coffea canephora (Robustakoffie) in het Congo-bassinVanaf1 jan 2019 → Heden
- Resistentie tegen de aardappelziekte introduceren in aardappel mbv CRISPRVanaf1 sep 2018 → 31 aug 2022
- Veredeling van kelp voor efficiënt en duurzaam gebruik van mariene bronnenVanaf1 mei 2018 → Heden
- Veredeling van voeder- en graan legumineuzen om de onafhankelijkhend van eiwitimport in de EU en China te verhogenVanaf1 sep 2017 → 31 dec 2021
- Effecten van de intensivering van het beheer van koffiebossen op de oogst, de oogstkwaliteit en de genetische bronnen van Arabicakoffie (Coffea arabica L.)Vanaf1 jan 2017 → 31 dec 2021
- Bridging landscape genomics and quantitative genetics for a regional adaptation of European grasslands to climate changeVanaf1 jan 2015 → 31 dec 2018
- Diepduiken in de genomische diversiteit van (meta)populatiesVanaf1 okt 2013 → 31 aug 2019
Publicaties
1 - 10 van 84
- Genetic diversity and structure in wild Robusta coffee (Coffea canephora A. Froehner) populations in Yangambi (DR Congo) and their relation to forest disturbance(2023)
Auteurs: , Lauren Verleysen, , , , , , , Yves Bawin, Ariane Staelens, et al.
Pagina's: 145-153 - BREEDIT: a multiplex genome editing strategy to improve complex quantitative traits in maize(2023)
Auteurs: Christian Damian Lorenzo, Kevin Debray, Denia Herwegh, Ward Develtere, Lennert Impens, Dries Schaumont, Wout Vandeputte, Stijn Aesaert, Griet Coussens, Yara De Boe, et al.
Pagina's: 218-238 - PotatoMASH-A Low Cost, Genome-Scanning Marker System for Use in Potato Genomics and Genetics Applications(2022)
Auteurs: Maria de la O. Leyva-Perez, Lea Vexler, Stephen Byrne, Corentin R. Clot, Fergus Meade, Denis Griffin, Tom Ruttink, Jie Kang, Dan Milbourne
- Fenotypische variatie en overerving van resistentie tegen anthracnose en klaverrot in rode klaver(2022)
Auteurs: Lea Frey, Tim Vleugels, Tom Ruttink, Franz Xaver Schubiger, Marie Pégard, Leif Skøt, Christoph Grieder, Bruno Studer, Isabel Roldán-Ruiz, Roland Koelliker
Pagina's: 4337-4349 - Identification of loci controlling timing of stem elongation in red clover using genotyping by sequencing of pooled phenotypic extremes(2022)
Auteurs: Åshild Ergon, Øystein W Milvang, Leif Skøt, Tom Ruttink
Pagina's: 1587-1600 - Chromosome-scale assembly and annotation of the perennial ryegrass genome(2022)
Auteurs: , Elisabeth Veeckman, , , , , Tom Ruttink,
Pagina's: 505 - Covering the Combinatorial Design Space of Multiplex CRISPR/Cas Experiments in Plants(2022)
Auteurs: Kirsten Van Huffel, Michiel Stock, Tom Ruttink, Bernard De Baets
- Genetic composition and diversity of Arabica coffee in the crop's centre of origin and its impact on four major fungal diseases(2022)
Auteurs: Beyene Hailu Zewdie, Yves Bawin, Ayco J. M. Tack, Sileshi Nemomissa, Kassahun Tesfaye, Steven B. Janssens, Sabine van Glabeke, Isabel Roldán-Ruiz, Tom Ruttink, , et al.
- Seasonal Differences in Structural and Genetic Control of Digestibility in Perennial Ryegrass(2022)
Auteurs: Vincent Colas, Philippe Barre, Frederik van Parijs, Lukas Wolters, Yannick Quitte, Tom Ruttink, Isabel Roldán-Ruiz, Abraham J. Escobar Gutierrez, Hilde Muylle
- Reciprocal allopolyploid grasses (Festuca × Lolium) display stable patterns of genome dominance(2021)
Auteurs: Marek Glombik, Dario Copetti, Jan Bartos, Stepan Stoces, Zbigniew Zwierzykowski, Tom Ruttink, Jonathan F Wendel, Martin Duchoslav, Jaroslav Dolezel, Bruno Studer, et al.
Pagina's: 1166-1182
Gelinkte datasets
1 - 8 van 8
- Multi-location trials and population-based genotyping reveal high diversity and adaptation to breeding environments in a large collection of red clover (Other)
- Phenotypic variation and quantitative trait loci for resistance to southern anthracnose and clover rot in red clover (Other)
- Phenotypic variation and quantitative trait loci for resistance to southern anthracnose and clover rot in red clover (Creator)
- Supplementary information accompanying the paper "Nematodes facilitate bacterial-mediated biogeochemical processes in marine sediments: a meta-transcriptomics approach" (Other)
- Data from: Canonical correlations reveal adaptive loci and phenotypic responses to climate in perennial ryegrass (Other)
- Data from: Unravelling hybridization in Phytophthora using phylogenomics and genome size estimation (Other)
- Orthology guided transcriptome assembly of Italian ryegrass and meadow fescue for single nucleotide polymorphisms discovery (data set) (Other)
- Orthology guided transcriptome assembly of Italian ryegrass and meadow fescue (update data set) (Other)