Onderzoeker
Stein Aerts
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Adaptive agents en intelligente robotica
- Disciplines (KU Leuven):Andere biologische wetenschappen
- Zie ook: Stein Aerts (Vlaams Instituut voor Biotechnologie)
Affiliaties
- Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Verantwoordelijke
Vanaf1 okt 2009 → Heden - VIB Center for AI & Computational Biology (Onderzoekscentrum)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jul 2023 → Heden - C20 Support (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jul 2023 → 31 dec 2023 - Dynamische Systemen, Signaalverwerking en Gegevensanalyse (STADIUS) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 aug 2020 → 30 sep 2004 - Aerts Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2017 → Heden - Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 okt 2009 → Heden - Departement Menselijke Erfelijkheid (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2005 → 30 nov 2017
Projecten
1 - 10 of 66
- Genregulatie begrijpen in een heel dier: Van het bouwen van een regulatie-atlas tot het decoderen van genregulatie met deep learningVanaf10 jan 2024 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SpaceTimeOmics: combinatie van hogedoorvoer spatial omics met AI om generegulatie te modeleren in een organisme doorheen de tijdVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Interpretatie van genomische regulatorische variatie in de menselijke hersenen en de ziekte van Parkinson, door integratie van deep learning en single-cell multi-omicsVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Deep learning gebaseerd synthetisch ontwerp en massaal parallelle reporterassays om celtype- specifieke enhancer te karakteriseren en te benuttenVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Enhancer-AI: AI-gestuurde modellering en ontwerp van celtype-specifieke versterkers voor gentherapieVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategisch Basisonderzoek (SBO)
- Deep learning oplossingen voor het ontcijferen van genregulatie in het menselijk breinVanaf7 mrt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Toepassingen van deep learning voor kankergenomicaVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Evolutie van de genomische regulatorische code die ten grondslag ligt aan neuronale diversiteitVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SymBioSys: Analyse van de genomische heterogeneïteit via de computationele analyse van lange DNA fragmentenVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Ontrafelen van genregulatie Drosophila melanogaster: naar een regulatiemap in één-cel resolutieVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
Publicaties
41 - 50 van 123
- Neuronal cell types in the fly: single-cell anatomy meets single-cell genomics(2019)
Auteurs: Jasper Janssens, Stein Aerts
Pagina's: 125 - 134 - Computational methods to unravel perturbed transcriptional regulation in cancer(2019)
Auteurs: Bram Van de Sande, Stein Aerts
- cisTopic: cis-regulatory topic modeling on single-cell ATAC-seq data(2019)
Auteurs: Liesbeth Minnoye, Dafni Papasokrati, Valerie Christiaens, Kristofer Davie, Jasper Wouters, Stein Aerts
Pagina's: 397 - + - Yin Yang 1 Orchestrates a Metabolic Program Required for Both Neural Crest Development and Melanoma Formation(2019)
Auteurs: Jasper Wouters, Stein Aerts
Pagina's: 637 - + - Establishment of the mayfly Cloeon dipterum as a new model system to investigate insect evolution(2019)
Auteurs: Kristofer Davie, Stein Aerts
- A comprehensive inventory of TLX1 controlled long non-coding RNAs in T-cell acute lymphoblastic leukemia through polyA plus and total RNA sequencing(2018)
Auteurs: Simon Bornschein, Charles De Bock, Stein Aerts, Jan Cools
Pagina's: E585 - E589 - A Single-Cell Transcriptome Atlas of the Aging Drosophila Brain(2018)
Auteurs: Kristofer Davie, Jasper Janssens, Uli Pech, Valerie Christiaens, Carmen Bravo González-Blas, Katina Spanier, Thomas Moerman, Sarah Geurs, Thierry Voet, Jeroen Lammertyn, et al.
Pagina's: 982 - 998 - Toward Minimal Residual Disease-Directed Therapy in Melanoma(2018)
Auteurs: Aljosja Rogiers, Michael Dewaele, Panagiotis Karras, Daniel Brown, Maria Debiec-Rychter, Carmen Adriaens, Oliver Bechter, Joost van den Oord, Thierry Voet, Stein Aerts, et al.
Pagina's: 843 - + - Amniotic ectoderm expansion in mouse occurs via distinct modes and requires SMAD5-mediated signalling (vol 145, dev157222, 2018)(2018)
Auteurs: Mariya P Dobreva, Vanesa Abon Escalona, Kirstie A Lawson, Marina N Sanchez, Ljuba Ponomarev, Paulo NG Pereira, Agata Stryjewska, Nathan Criem, Danny Huylebroeck, Susana M Chuva de Sousa Lopes, et al.
- Phenotype molding of stromal cells in the lung tumor microenvironment(2018)
Auteurs: Diether Lambrechts, Els Wauters, Bram Boeckx, David Nittner, Ayse Bassez, Andreas Pircher, Birgit Weynand, Erik Verbeken, Paul De Leyn, Adrian Liston, et al.
Pagina's: 1277 - +