Onderzoeker
Pieter Meysman
- Onderzoeksexpertise:Dr. Meysman is gespecialiseerd in het verwerken van biomedische data met artificiële intelligentie methoden.
- Trefwoorden:COMPUTATIONELE BIOLOGIE, BIO-INFORMATICA, IMMUNOGENECITEIT, Wiskunde
- Disciplines:Datamining, Machine learning en besluitvorming, Analyse van next-generation sequence data, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie, Computationele biomodellering en machine learning, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Immunogenetica, Vaccinologie
- Onderzoekstechnieken:Verschillende technieken behoren tot de expertise.
- Gebruikers van onderzoeksexpertise:Dr. Meysman heeft in het verleden al samengewerkt met ziekenhuizen, huisartsen, biotech- en pharmabedrijven.
Affiliaties
- ADReM Data Lab (ADReM) (Onderzoeksgroep)
Lid
Vanaf1 jan 2013 → Heden
Projecten
1 - 10 of 26
- "FunTCR": Karakterisering van specifieke humane TCR's via TCR-seq, door in silico en in vitro analyse van T-cellen gestimuleerd met tumorgeassocieerde en virale antigenen, om nieuwe TCR-T-cellen te ontwikkelen.Vanaf1 mrt 2024 → HedenFinanciering: Buitenl. VZW en equivalenten
- RAPTOR: een nieuw multi-view integrerend framework om de belangrijkste kenmerken van T-cel immunologie te identificeren.Vanaf1 nov 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Immunoinformatica voor vernieuwende diagnostiek in Lyme arthritis: zijn T-cellen de sleutel?Vanaf1 nov 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- PrioriTCR - Prioriteren van T-celreceptoren (TCR) voor ontwikkeling van T-celtherapie met behulp van immuno-informatica.Vanaf1 sep 2023 → HedenFinanciering: IOF - technologie concept exploratie
- Het diagnostisch potentieel van CD8 T cellen in de context van historische infectie.Vanaf1 jan 2023 → 30 sep 2023Financiering: Fonds Recuperatie Fiscale Vrijstelling
- Identificatie van het T cel receptor (TCR) repertoire dat aanwezig is in patienten met langdurige gewrichtspijnen tijdens chronische chikungunya virus ziekte.Vanaf1 jan 2023 → 30 sep 2023Financiering: Fonds Recuperatie Fiscale Vrijstelling
- Immunoinformatica voor vernieuwende diagnostiek in Lyme arthritis: zijn T-cellen de sleutel?Vanaf1 nov 2022 → 31 okt 2023Financiering: BOF - doctorale mandaten
- Nefrectomie-geïnduceerde regeneratie: een nieuw mechanistisch paradigma om nierherstel te stimuleren.Vanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Identificatie van T celreceptoren voor de ontwikkeling van nieuwe anti-leukemie therapieënVanaf7 sep 2022 → 31 okt 2023Financiering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- Voorspellen en modelleren van vaccinatie geïnduceerde immuunresponsen door de ontwikkeling van geadvanceerde computationele modellen voor immunosequencing data.Vanaf4 jul 2022 → 31 dec 2022Financiering: Andere Vlaamse wetenschappelijke instellingen
Publicaties
1 - 10 van 91
- Training of epitope-TCR prediction models with healthy donor-derived cancer-specific T cells(2024)
Auteurs: Donovan Flumens, Sofie Gielis, Esther Bartholomeus, Diana Campillo Davó, Maarten Versteven, Hans De Reu, Evelien Smits, Benson Ogunjimi, Kris Laukens, Pieter Meysman, et al.
Pagina's: 143 - 160 - Diagnosing viral infections through T cell receptor sequencing of activated CD8+ T cells(2024)
Auteurs: Alexandra Vujkovic, My Ha, Tessa de Block, Lida van Petersen, Isabel Brosius, Caroline Theunissen, Sabrina van Ierssel, Esther Bartholomeus, Wim Adriaensen, Guido Vanham, et al.
Pagina's: 507 - 516 - Lack of functional TCR-epitope interaction is associated with herpes zoster through reduced downstream T cell activation(2024)
Auteurs: Marlies Boeren, Nicky de Vrij, Sebastiaan Valkiers, Aisha Souquette, Sofie Gielis, Mariia Kuznetsova, Jolien Schippers, Esther Bartholomeus, Johan Van den Bergh, Nele Michels, et al.
Pagina's: 1 - 18 - Clinical decision support for improved neonatal care(2024)
Auteurs: Marisse Meeus, Charlie Beirnaert, Ludo Mahieu, Kris Laukens, Pieter Meysman, Antonius Mulder, David Van Laere
Pagina's: 1 - 10 - Kynurenine pathway abnormalities are state-specific but not diagnosis-specific in schizophrenia and bipolar disorder(2023)
Auteurs: Katrien Skorobogatov, Valérie Autier, Marianne Foiselle, Jean-Romain Richard, Wahid Boukouaci, Ching-Lien Wu, Sophie Raynal, Christel Carbonne, Pieter Meysman, Violette Coppens, et al.
Pagina's: 1 - 11 - Multi-view learning to unravel the different levels underlying hepatitis B vaccine response(2023)
Auteurs: Fabio Affaticati, Esther Bartholomeus, Kerry Mullan, Pierre Van Damme, Philippe Beutels, Benson Ogunjimi, Kris Laukens, Pieter Meysman
Pagina's: 1 - 19 - Analysis of Wilms’ tumor protein 1 specific TCR repertoire in AML patients uncovers higher diversity in patients in remission than in relapsed(2023)
Auteurs: Sofie Gielis, Donovan Flumens, Maarten Versteven, Hans De Reu, Esther Bartholomeus, Jolien Schippers, Diana Campillo Davó, Zwi Berneman, Sébastien Anguille, Evelien Smits, et al.
Aantal pagina's: 24 - Interpretable deep learning to uncover the molecular binding patterns determining TCR–epitope interaction predictions(2023)
Auteurs: Ceder Dens, Fabio Affaticati, Kris Laukens, Pieter Meysman
Pagina's: 1 - 9 - Leveraging T-cell receptor – epitope recognition models to disentangle unique and cross-reactive T-cell response to SARS-CoV-2 during COVID-19 progression/resolution(2023)
Auteurs: Anna Postovskaya, Alexandra Vujkovic, Tessa de Block, Lida van Petersen, Maartje van Frankenhuijsen, Isabel Brosius, Emmanuel Bottieau, Christophe Van Dijck, Caroline Theunissen, Sabrina van Ierssel, et al.
Pagina's: 1 - 14 - Clustering and annotation of T cell receptor repertoires(2023)
Auteurs: Sebastiaan Valkiers, Sofie Gielis, Vincent Van Deuren, Kris Laukens, Pieter Meysman
Pagina's: 33 - 51
Patenten
1 - 2 van 2
Gelinkte datasets
1 - 3 van 3
- Data for "Current challenges for unseen-epitope TCR interaction prediction and a new perspective derived from image classification" (ImRex) (Creator)
- Preexisting memory CD4 T cells in naïve individuals confer robust immunity upon vaccination (Creator)
- MESSAR: Automated recommendation of metabolite substructures from tandem mass spectra (Creator)