Onderzoeker
Pieter Mestdagh
- Trefwoorden:RNA, kanker, Transcriptoomanalyse, niet-coderend RNA
- Disciplines:Analyse van next-generation sequence data, Kankerdiagnose, Kankertherapie, Moleculaire diagnostiek, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Computationele transcriptomics en epigenomics, Bio-informatica van ziekten, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie, Kankerbiologie, Transcriptie en translatie, Epigenetica, Genoomstructuur en -regulatie, Genetica
Affiliaties
- Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → Heden - Vakgroep Pediatrie en genetica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2006 → 30 sep 2018
Projecten
1 - 10 of 38
- Plasma cell vrij RNA biomerker tail genen voor screenen en opvolgen van kankerpatiëntenVanaf15 okt 2023 → HedenFinanciering: IOF - technologie concept exploratie
- Verhoging van de investeringswaarde van de IOF programma's CRISParray en Amalus: CRISPRi-gebaseerde opheldering van het moleculaire target van fibroblastmodulatorenVanaf15 jul 2023 → HedenFinanciering: IOF - technologie validatie in labo
- Integratie van moleculaire en cellulaire fenotypes: optimalisatie van RNA-seq en high content microscopy voor het CRISParray platformVanaf1 mei 2023 → HedenFinanciering: IOF - technologie concept exploratie
- Een nieuw foto-elektrochemisch singlet zuurstof gebaseerd detectieplatform voor een panel van kankerbiomerkers in weefsel- en vloeibare biopsieën (SOCAN)Vanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: BOF - iBOF
- Identificatie van lange niet-coderende RNAs die T-cell activatie modulerenVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- Lange niet-coderende RNAs betrokken in de regulatie van tumor immunogeniciteitVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Incucyte S3: Uitgebreide cellulaire fenotypering met behulp van hoge doorvoer live-cel beeldvormingVanaf15 dec 2022 → HedenFinanciering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Functionele studie van een nieuwe, lange niet-coderende RNA (lncRNA) upstream van ABCA4 in de retina en in blindheidVanaf1 nov 2022 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- In kaart brengen en verstoren van interactie sites van het lange niet-coderende RNA NESPR in neuroblastoomVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: BOF - postdoctorale mandaten
- CRISParray: medicijnen sneller ontdekken door uitgebreide cellulaire en moleculaire fenotyperingVanaf1 aug 2022 → HedenFinanciering: IWT /VLAIO persoonsgebonden financ. - innovatiemandaten
Publicaties
41 - 50 van 261
- Distinct Notch1 and BCL11B requirements mediate human γδ/αβ T cell development(2020)
Auteurs: Anne-Catherine Dolens, Kaat Durinck, Marieke Lavaert, Joni Van der Meulen, Imke Velghe, Jelle De Medts, Karin Weening, Juliette Roels, Katrien De Mulder, Pieter-Jan Volders, et al.
- The long noncoding RNA lncNB1 promotes tumorigenesis by interacting with ribosomal protein RPL35(2019)
Auteurs: Pei Y Liu, Andrew E Tee, Giorgio Milazzo, Katherine M Hannan, Jesper Maag, Sujanna Mondal, Bernard Atmadibrata, Nenad Bartonicek, Hui Peng, Nicholas Ho, et al.
- Dramatic differences in RNA purification kit performance in the extracellular RNA quality control study : important considerations for liquid biopsies(2019)
Auteurs: Francisco Avila Cobos, Carolina Fierro, Hetty Helsmoortel, An Hendrix, Eva Hulstaert, Scott Kuersten, Pieter Mestdagh, Nele Nijs, Justine Nuytens, Annouck Philippron, et al.
Aantal pagina's: 1 - Benchmarking the impact of data transformation, pre-processing and choice of method in the computational deconvolution of transcriptomics data(2019)
Auteurs: Francisco Avila Cobos, José Alquicira-Hernandez, Jo Vandesompele, Joseph Powell, Pieter Mestdagh, Katleen De Preter
Aantal pagina's: 1 - Lack of adequate reporting of pre-analytical variables in RNA based liquid biopsies studies hampers quality assessment and replication(2019)
Auteurs: Pieter Mestdagh, Céleste Van Der Schueren, Hetty Helsmoortel, Eva Hulstaert
Aantal pagina's: 1 - Integrative analysis identifies lincRNAs up- and downstream of neuroblastoma driver genes(2019)
Auteurs: Dries Rombaut, Hua-Sheng Chiu, Bieke Decaesteker, Agathe Pelthier, Isabelle Janoueix, Christophe Bartenhagen, Matthias Fischer, Stephen Roberts, Nicky D'Haene, Geertrui Denecker, et al.
- SMARTer single cell total RNA sequencing(2019)
Auteurs: Karen Verboom, Nathalie Bolduc, Kenneth Livak, Dries Rombaut, Morten Venø, Jørgen Kjems, Pieter Mestdagh
Aantal pagina's: 1 - SMARTer single cell total RNA-sequencing(2019)
Auteurs: Karen Verboom, Celine Everaert, Nathalie Bolduc, Kenneth Livak, Nurten Yigit, Dries Rombaut, Jasper Anckaert, Simon Lee, Morten Venø, Jørgen Kjems, et al.
- The generation and use of recombinant extracellular vesicles as biological reference material(2019)
Auteurs: Edward Geeurickx, Joeri Tulkens, Bert Dhondt, Jan Van Deun, Lien Lippens, Glenn Vergauwen, Elisa Heyrman, Delphine De Sutter, Kris Gevaert, Francis Impens, et al.
- Plasma miRNAs as biomarkers for endometriosis(2019)
Auteurs: A. Vanhie, D. Peterse, A. Beckers, A. Cuellar, A. Fassbender, C. Meuleman, Pieter Mestdagh, T. D'Hooghe
Pagina's: 1650 - 1660
Patenten
1 - 9 van 9
- Inhibition of a lncRNA for treatment of neuroblastoma (Inventor)
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma (Inventor)
- Combinations of therapeutic agents for treating uveal melanoma (Inventor)
- Biomarkers for disease burden of neuroblastoma (Inventor)
- Usages of recombinant extracellular vesicles (Inventor)
- Inhibition of a lncRNA for treatment of neuroblastoma (Inventor)
- Biomarkers for disease burden of neuroblastoma (Inventor)
- Usages of recombinant extracellular vesicles (Inventor)
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma (Inventor)