Onderzoeker
Pieter Mestdagh
- Trefwoorden:RNA, kanker, Transcriptoomanalyse, niet-coderend RNA
- Disciplines:Analyse van next-generation sequence data, Kankerdiagnose, Kankertherapie, Moleculaire diagnostiek, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Computationele transcriptomics en epigenomics, Bio-informatica van ziekten, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie, Kankerbiologie, Transcriptie en translatie, Epigenetica, Genoomstructuur en -regulatie, Genetica
Affiliaties
- Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → Heden - Vakgroep Pediatrie en genetica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2006 → 30 sep 2018
Projecten
1 - 10 of 38
- Plasma cell vrij RNA biomerker tail genen voor screenen en opvolgen van kankerpatiëntenVanaf15 okt 2023 → HedenFinanciering: IOF - technologie concept exploratie
- Verhoging van de investeringswaarde van de IOF programma's CRISParray en Amalus: CRISPRi-gebaseerde opheldering van het moleculaire target van fibroblastmodulatorenVanaf15 jul 2023 → HedenFinanciering: IOF - technologie validatie in labo
- Integratie van moleculaire en cellulaire fenotypes: optimalisatie van RNA-seq en high content microscopy voor het CRISParray platformVanaf1 mei 2023 → HedenFinanciering: IOF - technologie concept exploratie
- Een nieuw foto-elektrochemisch singlet zuurstof gebaseerd detectieplatform voor een panel van kankerbiomerkers in weefsel- en vloeibare biopsieën (SOCAN)Vanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: BOF - iBOF
- Identificatie van lange niet-coderende RNAs die T-cell activatie modulerenVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- Lange niet-coderende RNAs betrokken in de regulatie van tumor immunogeniciteitVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Incucyte S3: Uitgebreide cellulaire fenotypering met behulp van hoge doorvoer live-cel beeldvormingVanaf15 dec 2022 → HedenFinanciering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Functionele studie van een nieuwe, lange niet-coderende RNA (lncRNA) upstream van ABCA4 in de retina en in blindheidVanaf1 nov 2022 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- In kaart brengen en verstoren van interactie sites van het lange niet-coderende RNA NESPR in neuroblastoomVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: BOF - postdoctorale mandaten
- CRISParray: medicijnen sneller ontdekken door uitgebreide cellulaire en moleculaire fenotyperingVanaf1 aug 2022 → HedenFinanciering: IWT /VLAIO persoonsgebonden financ. - innovatiemandaten
Publicaties
21 - 30 van 261
- Robust sequential biophysical fractionation of blood plasma to study variations in the biomolecular landscape of systemically circulating extracellular vesicles across clinical conditions(2021)
Auteurs: Glenn Vergauwen, Joeri Tulkens, Francisco Avila Cobos, Marie-Angélique De Scheerder, Ilkka Miinalainen, Pieter Mestdagh, Hannelore Denys, An Hendrix
- Evaluating diagnostic accuracy of saliva sampling methods for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 reveals differential sensitivity and association with viral load(2021)
Auteurs: Pieter Mestdagh, Michel Gillard, Sharonjit K. Dhillon, Jean-Paul Pirnay, Jeroen Poels, Jan Hellemans, Veronik Hutse, Celine Vermeiren, Maxime Boutier, Veerle De Wever, et al.
Pagina's: 1249 - 1258 - RNAcentral 2021 : secondary structure integration, improved sequence search and new member databases(2021)
Auteurs: Blake A. Sweeney, I Petrov, Anton, Carlos E. Ribas, Robert D. Finn, Alex Bateman, Maciej Szymanski, Wojciech M. Karlowski, Stefan E. Seemann, Jan Gorodkin, Jamie J. Cannone, et al.
Pagina's: D212 - D220 - Genome-wide study of the effect of blood collection tubes on the cell-free DNA methylome(2021)
Auteurs: Ruben Van Paemel, Andries De Koker, Christa Caggiano, Pieter Mestdagh
Pagina's: 797 - 807 - The RNA Atlas expands the catalog of human non-coding RNAs (June, 10.1038/s41587-021-00936-1, 2021)(2021)
Auteurs: Lucia Lorenzi, Hua-Sheng Chiu, Francisco Avila Cobos, Stephen Gross, Justine Nuytens, Katrien Vanderheyden, Aidan Tay, Eric J. de Bony, Fien Gysens, Marieke Vromman, et al.
Pagina's: 1467 - 1467 - The MicroRNA landscape of acute beta cell destruction in type 1 diabetic recipients of intraportal islet grafts(2021)
Auteurs: Geert Martens, Geert Stangé, Lorenzo Piemonti, Zhidong Ling, Daniel G. Pipeleers, Frans K. Gorus, Pieter Mestdagh, Dieter De Smet, Bart Keymeulen, Sarah Roels
- Recurrent chromosomal imbalances provide selective advantage to human embryonic stem cells under enhanced replicative stress conditions(2021)
Auteurs: Liselot Mus, Stéphane Van Haver, Mina Popovic, Wim Trypsteen, Steve Lefever, Nadja Zeltner, Yudelca Ogando, Eva Jacobs, Geertrui Denecker, Ellen Sanders, et al.
Pagina's: 272 - 281 - A microRNA-21–mediated SATB1/S100A9/NF-κB axis promotes chronic obstructive pulmonary disease pathogenesis(2021)
Auteurs: Richard Y. Kim, Krishna P. Sunkara, Ken R. Bracke, Andrew G. Jarnicki, Chantal Donovan, Alan C. Hsu, Antonio Ieni, Emma L. Beckett, Izabela Galvão, Sara Wijnant, et al.
- Targeted therapy of TERT-rearranged neuroblastoma with BET bromodomain inhibitor and proteasome inhibitor combination therapy(2021)
Auteurs: Jingwei Chen, Christopher Nelson, Matthew Wong, Andrew E. Tee, Pei Y. Liu, Ting La, Jamie I. Fletcher, Alvin Kamili, Chelsea Mayoh, Christoph Bartenhagen, et al.
Pagina's: 1438 - 1451 - Messenger RNA capture sequencing of extracellular RNA from human biofluids using a comprehensive set of spike-in controls(2021)
Auteurs: Eva Hulstaert, Kimberly Verniers, Justine Nuytens, Nele Nijs, Gary P. Schroth, Scott Kuersten, Stephen M. Gross, Pieter Mestdagh
Patenten
1 - 9 van 9
- Inhibition of a lncRNA for treatment of neuroblastoma (Inventor)
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma (Inventor)
- Combinations of therapeutic agents for treating uveal melanoma (Inventor)
- Biomarkers for disease burden of neuroblastoma (Inventor)
- Usages of recombinant extracellular vesicles (Inventor)
- Inhibition of a lncRNA for treatment of neuroblastoma (Inventor)
- Biomarkers for disease burden of neuroblastoma (Inventor)
- Usages of recombinant extracellular vesicles (Inventor)
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma (Inventor)