Onderzoeker
Pieter Mestdagh
- Disciplines:Analyse van next-generation sequence data, Kankerdiagnose, Kankertherapie, Moleculaire diagnostiek, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Computationele transcriptomics en epigenomics, Bio-informatica van ziekten, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie, Kankerbiologie, Transcriptie en translatie, Epigenetica, Genoomstructuur en -regulatie, Genetica
Affiliaties
- Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → Heden - Vakgroep Pediatrie en genetica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2006 → 30 sep 2018
Projecten
1 - 10 of 24
- Identificatie van karakteristieken typerend voor functionele lange niet-coderende RNAs door middel van seriële cellulaire en moleculaire fenotypering.Vanaf1 jan 2022 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject
- Implementatie van een longitudinaal meerdere omics voorspellingsmodel voor respons op immunologische controle punt remmenVanaf1 okt 2021 → 28 feb 2022Financiering: BOF - postdoctorale mandaten
- Kankerspecifieke circulerende RNAs als biomerkers voor diagnose en opvolging van therapieresponsVanaf1 nov 2020 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Strategieën tegen aanhoudende hiv-1-reservoirsVanaf1 jan 2020 → HedenFinanciering: FWO Strategisch Basisonderzoek (SBO)
- De rol van super-enhancer gereguleerd SOX11 in regulatie van SWI/SNF en PRC2 activiteit in adrenerge neuroblastomasVanaf1 nov 2019 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Kankerspecifieke circulerende RNAs als biomerkers voor diagnose en opvolging van therapieresponsVanaf1 okt 2019 → 31 okt 2020Financiering: BOF - doctorale mandaten
- individualizedPaediatricCure: Cloud-based virtual-patient models for precision paediatric onocologyVanaf1 jan 2019 → HedenFinanciering: H2020 - Gezondheid, demografische verandering en welzijn
- RNA-MAGIC: RNA-gebaseerde bioMerkers en tArGets In astma en Chronisch obstructief longlijden (COPD)Vanaf1 jan 2019 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Long non-coding RNAs in HIV latentie: een nieuwe invalshoek in de zoektocht naar efficiëntere latentie reactivatie voor shock-and-kill genezingsstrategieën.Vanaf1 jan 2019 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Het neuroblastoom-specifieke lncRNA NESPR als een cruciale regulator van neuroblastoom cel identiteit en overlevingVanaf1 jan 2019 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject
Publicaties
1 - 10 van 226
- Open problems in extracellular RNA data analysis : insights from an ERCC online workshop(2022)
Auteurs: Roger P. Alexander, Robert R. Kitchen, Juan Pablo Tosar, Matthew Roth, Pieter Mestdagh, Klaas E. A. Max, Joel Rozowsky, Karolina Elzbieta Kaczor-Urbanowicz, Justin Chang, Leonora Balaj, et al.
Aantal pagina's: 1 - Orthogonal proteomics methods to unravel the HOTAIR interactome(2022)
Auteurs: Louis Delhaye, Edith De Bruycker, Pieter-Jan Volders, Daria Fijalkowska, Delphine De Sutter, Sven Degroeve, Lennart Martens, Pieter Mestdagh, Sven Eyckerman
Aantal pagina's: 1 - Reliable and scalable SARS-CoV-2 qPCR testing at a high sample throughput : lessons learned from the Belgian initiative(2022)
Auteurs: Steven Van Vooren, James Grayson, Marc Van Ranst, Elisabeth Dequeker, Lies Laenen, Reile Janssen, Laurent Gillet, Fabrice Bureau, Wouter Coppieters, Nathalie Devos, et al.
Aantal pagina's: 1 - CiLiQuant : quantification of RNA junction reads based on their circular or linear transcript origin(2022)
Auteurs: Annelien Morlion, Eva Hulstaert, Marieke Vromman, Jasper Anckaert, Celine Everaert, Joke Vandesompele, Pieter Mestdagh
Aantal pagina's: 1 - RNA biomarkers from proximal liquid biopsy for diagnosis of ovarian cancer(2022)
Auteurs: Eva Hulstaert, Keren Levanon, Annelien Morlion, Stefan Van Aelst, Anthony-Alexander Christidis, Ruben Zamar, Jasper Anckaert, Kimberly Verniers, Keren Bahar-Shany, Stav Sapoznik, et al.
Pagina's: 155 - 164 - Unlocking the secrets of long non-coding RNAs in asthma(2022)
Auteurs: Fien Gysens, Pieter Mestdagh, Eric de Bony de Lavergne, Tania Maes
Pagina's: 514 - 522 - Transient nuclear lamin A/C accretion aids in recovery from vapor nanobubble-induced permeabilisation of the plasma membrane(2022)
Auteurs: Gaëlle Houthaeve, Gerardo García-Díaz Barriga, Stephan Stremersch, Herlinde De Keersmaecker, Juan Carlos Fraire, Joke Vandesompele, Pieter Mestdagh, Stefaan De Smedt, Kevin Braeckmans, Winnok De Vos
Aantal pagina's: 1 - A microRNA-21U+2013mediated SATB1/S100A9/NF-U+03BAB axis promotes chronic obstructive pulmonary disease pathogenesis(2021)
Auteurs: Richard Y. Kim, Krishna P. Sunkara, Ken R. Bracke, Andrew G. Jarnicki, Chantal Donovan, Alan C. Hsu, Antonio Ieni, Emma L. Beckett, Izabela Galvão, Sara Wijnant, et al.
Aantal pagina's: 1 - Evaluating diagnostic accuracy of saliva sampling methods for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 reveals differential sensitivity and association with viral load(2021)
Auteurs: Pieter Mestdagh, Michel Gillard, Sharonjit K. Dhillon, Jean-Paul Pirnay, Jeroen Poels, Jan Hellemans, Veronik Hutse, Celine Vermeiren, Maxime Boutier, Veerle De Wever, et al.
Pagina's: 1249 - 1258 - Messenger RNA capture sequencing of extracellular RNA from human biofluids using a comprehensive set of spike-in controls(2021)
Auteurs: Eva Hulstaert, Anneleen Decock, Annelien Morlion, Celine Everaert, Kimberly Verniers, Justine Nuytens, Nele Nijs, Gary P. Schroth, Scott Kuersten, Stephen M. Gross, et al.
Aantal pagina's: 1