Onderzoeker
Pieter Mestdagh
- Disciplines:Analyse van next-generation sequence data, Kankerdiagnose, Kankertherapie, Moleculaire diagnostiek, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Computationele transcriptomics en epigenomics, Bio-informatica van ziekten, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie, Kankerbiologie, Transcriptie en translatie, Epigenetica, Genoomstructuur en -regulatie, Genetica
Affiliaties
- Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → Heden - Vakgroep Pediatrie en genetica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2006 → 30 sep 2018
Projecten
1 - 10 of 21 results
- Kankerspecifieke circulerende RNAs als biomerkers voor diagnose en opvolging van therapieresponsVanaf1 nov 2020 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- De rol van super-enhancer gereguleerd SOX11 in regulatie van SWI/SNF en PRC2 activiteit in adrenerge neuroblastomasVanaf1 nov 2019 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Kankerspecifieke circulerende RNAs als biomerkers voor diagnose en opvolging van therapieresponsVanaf1 okt 2019 → 31 okt 2020Financiering: BOF - doctorale mandaten
- individualizedPaediatricCure: Cloud-based virtual-patient models for precision paediatric onocologyVanaf1 jan 2019 → HedenFinanciering: H2020 - Gezondheid, demografische verandering en welzijn
- Long non-coding RNAs in HIV latentie: een nieuwe invalshoek in de zoektocht naar efficiëntere latentie reactivatie voor shock-and-kill genezingsstrategieën.Vanaf1 jan 2019 → 31 dec 2020Financiering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- RNA-MAGIC: RNA-gebaseerde bioMerkers en tArGets In astma en Chronisch obstructief longlijden (COPD)Vanaf1 jan 2019 → HedenFinanciering: BOF - Geconcert. Onderzoeksacties vanaf 1994
- Het neuroblastoom-specifieke lncRNA NESPR als een cruciale regulator van neuroblastoom cel identiteit en overlevingVanaf1 jan 2019 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject
- Computationele deconvolutie van plasma-RNA-profielenVanaf1 sep 2018 → 31 aug 2019Financiering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- Functionele analyse van de neuroblastoma-specifieke IncRNA LINC00682Vanaf1 jan 2018 → 31 dec 2018Financiering: VZW en equivalenten
- BOF-ZAP-ambt in Bio-informatics, functional genomics, RNA-biology, oncologyVanaf1 okt 2017 → HedenFinanciering: BOF - ZAP BOF-mandaten
Publicaties
1 - 10 of 203 results
- Recurrent chromosomal imbalances provide selective advantage to human embryonic stem cells under enhanced replicative stress conditions(2021)
Auteurs: Liselot Mus, Stéphane Van Haver, Mina Popovic, Wim Trypsteen, Steve Lefever, Nadja Zeltner, Yudelca Ogando, Eva Jacobs, Geertrui Denecker, Ellen Sanders, et al.
Pagina's: 272 - 281 - Benchmarking of cell type deconvolution pipelines for transcriptomics data(2020)
Auteurs: Francisco Avila Cobos, José Alquicira-Hernandez, Joseph E. Powell, Pieter Mestdagh, Katleen De Preter
Aantal pagina's: 1 - Vapor nanobubble is the more reliable photothermal mechanism for inducing endosomal escape of siRNA without disturbing cell homeostasis(2020)
Auteurs: Juan Carlos Fraire, Gaëlle Houthaeve, Jing Liu, Laurens Raes, Lotte Vermeulen, Stephan Stremersch, Toon Brans, Gerardo Garcia-Diaz Barriga, Sarah De Keulenaer, Filip Van Nieuwerburgh, et al.
Pagina's: 262 - 275 - Performance assessment of total RNA sequencing of human biofluids and extracellular vesicles(2020)Volume: 26
Auteurs: Celine Everaert, Hetty Helsmoortel, Anneleen Decock, Eva Hulstaert, Ruben Van Paemel, Kimberly Verniers, Justine Nuytens, Jasper Anckaert, Nele Nijs, Joeri Tulkens, et al.
Pagina's: 94 - 95 - Distinct Notch1 and BCL11B requirements mediate human U+03B3U+03B4/U+03B1U+03B2 T cell development(2020)
Auteurs: Anne-Catherine Dolens, Kaat Durinck, Marieke Lavaert, Joni Van der Meulen, Imke Velghe, Jelle De Medts, Karin Weening, Juliette Roels, Katrien De Mulder, Pieter-Jan Volders, et al.
Aantal pagina's: 1 - Benchmarking the impact of data transformation, pre-processing and choice of method in the computational deconvolution of transcriptomics data(2019)
Auteurs: Francisco Avila Cobos, José Alquicira-Hernandez, Joke Vandesompele, Joseph Powell, Pieter Mestdagh, Katleen De Preter
Aantal pagina's: 1 - SMARTer single cell total RNA-sequencing(2019)
Auteurs: Karen Verboom, Celine Everaert, Nathalie Bolduc, Kenneth Livak, Nurten Yigit, Dries Rombaut, Jasper Anckaert, Simon Lee, Morten Venø, Jørgen Kjems, et al.
Aantal pagina's: 1 - Integrative analysis identifies lincRNAs up- and downstream of neuroblastoma driver genes(2019)
Auteurs: Dries Rombaut, Hua-Sheng Chiu, Bieke Decaesteker, Celine Everaert, Nurten Yigit, Agathe Pelthier, Isabelle Janoueix, Christophe Bartenhagen, Matthias Fischer, Stephen Roberts, et al.
Aantal pagina's: 1 - Long noncoding RNA expression profiling in cancer : challenges and opportunities(2019)
Auteurs: Lucia Lorenzi, Francisco Avila Cobos, Anneleen Decock, Celine Everaert, Hetty Helsmoortel, Steve Lefever, Karen Verboom, Pieter-Jan Volders, Franki Speleman, Joke Vandesompele, et al.
Pagina's: 191 - 199 - The generation and use of recombinant extracellular vesicles as biological reference material(2019)
Auteurs: Edward Geeurickx, Joeri Tulkens, Bert Dhondt, Jan Van Deun, Lien Lippens, Glenn Vergauwen, Elisa Heyrman, Delphine De Sutter, Kris Gevaert, Francis Impens, et al.
Aantal pagina's: 1