Onderzoeker
Petra Van Damme
- Trefwoorden:genoom (re-)annotatie, (alternatieve) translatie initiatie, bacteriële pathogeen, proteovormen, proteomics, riboproteogenomics, gastheer-microbe interactie
- Disciplines:Transcriptie en translatie, Proteomics, Transcriptomics, Interactomics, Infectieziekten
Affiliaties
- Vakgroep Biochemie en Microbiologie (Departement)
Lid
Vanaf1 mrt 2019 → Heden - Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → 28 feb 2019 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 mei 2018 → 30 sep 2018 - Vakgroep Biochemie (Departement)
Lid
Vanaf1 feb 2003 → 30 sep 2018 - Vakgroep Biomedische Moleculaire Biologie (Departement)
Lid
Vanaf1 jan 2002 → 31 aug 2002
Projecten
1 - 10 of 18
- Microarrays voor de fenotypische karakterisatie van reinculturen, bacteriële mutanten en microbiële gemeenschappenVanaf15 dec 2022 → HedenFinanciering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Het ontrafelen van de heterogene aard van gastheer/pathogeen interacties en hun rol in bacteriële pathogenese.Vanaf1 jan 2021 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject
- Een MALDI-8020 massaspectrometer voor analyse van peptiden en eiwitten.Vanaf1 dec 2020 → 30 nov 2022Financiering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Preparatieve en analytische ultracentrifugatie ter ondersteuning van integratieve multi-omics studies.Vanaf1 dec 2020 → 30 nov 2022Financiering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Identificatie van in planta gesecreteerde fungale effectoren en karakterisering van de tomaat proteinen waarmee ze interageren ter verbetering van arbusculaire mycorrhiza gebaseerde landbouwVanaf1 nov 2020 → 31 okt 2022Financiering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Riboproteogenomics van het sORF-gecodeerde SalmonellapeptidoomVanaf1 jan 2020 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject
- Het ontrafelen van de arbusculaire mycorrhiza-plant interface voor een verhoogde tomaten opbrengst bij drogere condities.Vanaf1 nov 2019 → 22 jul 2022Financiering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Eiwit communicatie tijdens de ontwikkeling van arbusculaire mycorrhiza: het ontrafelen van de functie van tomatenworteleiwitten die interageren met schimmel effectorenVanaf1 nov 2019 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Proteogenomics exploratie van de moleculaire mechanismen die aan de basis liggen van Salmonella infectieVanaf1 okt 2019 → 31 mrt 2022Financiering: BOF - postdoctorale mandaten
- Riboproteogenomics van de interactie tussen bacteriële pathogeen en zijn gastheerVanaf15 apr 2019 → HedenFinanciering: BOF - projecten
Publicaties
1 - 10 van 91
- Identification of plant protein-metabolite interactions by limited proteolysis-coupled mass spectrometry (LiP-MS)(2023)Series: Methods in Molecular Biology
Auteurs: Jhon Jairo Venegas Molina, Petra Van Damme, Alain Goossens, Aleksandra Skirycz, Marcin Luzarowski, Jennifer C. Ewald
Pagina's: 47 - 67 - Hidden in plain sight : challenges in proteomics detection of small ORF-encoded polypeptides(2022)
Auteurs: Igor Fijalkowski, Patrick Willems, Veronique Jonckheere, Laure Simoens, Petra Van Damme
- Small protein enrichment improves proteomics detection of sORF encoded polypeptides(2021)
Auteurs: Igor Fijalkowski, Marlies Peeters, Petra Van Damme
- Capturing salmonella SspH2 host targets in virus-like particles(2021)
Auteurs: Margaux De Meyer, Igor Fijalkowski, Veronique Jonckheere, Delphine De Sutter, Sven Eyckerman, Petra Van Damme
- Charting the N-terminal acetylome : a comprehensive map of human NatA substrates(2021)
Auteurs: Petra Van Damme
- Mechanisms of congenital heart disease caused by NAA15 haploinsufficiency(2021)
Auteurs: Tarsha L. Ward, Warren Tai, Sarah U. Morton, Francis Impens, Petra Van Damme, Delphi Van Haver, Evy Timmerman, Gabriela Venturini, Kehan Zhang, Min Young Jang, et al.
Pagina's: 1156 - 1169 - N-terminal acetyltransferase Naa40p whereabouts put into N-terminal proteoform perspective(2021)
Auteurs: Veronique Jonckheere, Petra Van Damme
- Bacterial riboproteogenomics : the era of N-terminal proteoform existence revealed(2020)
Auteurs: Daria Fijalkowska, Igor Fijalkowski, Patrick Willems, Petra Van Damme
Pagina's: 418 - 431 - Bacterial genetic engineering by means of recombineering for reverse genetics(2020)
Auteurs: Ursula Fels, Kris Gevaert, Petra Van Damme
- Establishment of proximity-dependent biotinylation approaches in different plant model systems(2020)
Auteurs: Deepanksha Arora, Nikolaj B. Abel, Chen Liu, Petra Van Damme, Klaas Yperman, Dominique Eeckhout, Lam Dai Vu, Jie Wang, Anna Tornkvist, Francis Impens, et al.
Pagina's: 3388 - 3407