Onderzoeker
Klaas Vandepoele
- Trefwoorden (Ghent University):systeembiologie, bioinformatica, Plantenbiotechnologie
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Celdood en senescentie, Invasiebiologie, Epigenomics, Auto-ecologie, Biogeografie en fylogeografie
- Disciplines (Ghent University):Ontologieën, datacuratie en text mining, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Systeembiologie niet elders geclassificeerd, Cel- en moleculaire biologie van planten, Single-cell data analyse, Analyse van next-generation sequence data, Bio-informatica en computationele biologie niet elders geclassificeerd, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie
Affiliaties
- Vandepoele Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2018 → Heden - De Veylder Lab (Onderzoeksgroep)
Lid
Vanaf1 jan 2017 → 31 dec 2017 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 dec 2000 → Heden
Infrastructuur
1 - 1 van 1
- ELIXIR België (Consortium partner)
Projecten
1 - 10 of 18
- De verborgen tuin: adaptatie en evolutie van diatomeeën in benthische habitatsVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Beoordeling van de rollen van endogene en omgevingsfactoren die de celgrootteverdeling en seksuele reproductie in benthische diatomeeënpopulaties regelenVanaf1 nov 2022 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Het in kaart brengen van functionele componenten van de diverse levenscycli in diatomeeën.Vanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele celVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Identificatie van het gen regulerende netwerken vasculaire ontwikkeling in planten - een vergelijkende benadering op single-cell resolutieVanaf1 okt 2021 → 14 okt 2022Financiering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Enzym biodiscovery-pijplijnoptimalisatie via toolbox-ontwikkelingVanaf1 sep 2021 → HedenFinanciering: VLAIO - Catalisti - cSBO
- Software ontwikkeling voor ontdekking en prioritizering van genen belangrijk voor plant-eigenschappen op basis van single-cell moleculaire profilering.Vanaf1 jun 2021 → 31 dec 2023Financiering: IOF - technologie validatie in labo
- Reproductieve barrières, interspecifieke gene flow en diversificatie in een wereldwijd voorkomende pennate diatomeeVanaf1 jan 2021 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Van modelsysteem tot gewas: een network-gebaseerde benadering voor het accuraat vertalen van biologische kennis in plantenVanaf1 okt 2019 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- ELIXIR Infrastructuur voor Data en Services om Life-Sciences Onderzoek in Vlaanderen te versterkenVanaf1 jan 2019 → 31 dec 2022Financiering: FWO Internationale onderzoeksinfrastructuur (IRI)
Publicaties
11 - 20 van 133
- Chromosome-scale assembly and annotation of the perennial ryegrass genome(2022)
Auteurs: Istvan Nagy, Chang Liu, Michiel Van Bel, Klaas Vandepoele, Christian Sig Jensen, Tom Ruttink, Torben Asp
- Integrative inference of transcriptional networks in Arabidopsis yields novel ROS signalling regulators(2022)Volume: 189
Auteurs: Inge De Clercq, Jan Van de Velde, Xiaopeng Luo, Li Liu, Veronique Storme, Michiel Van Bel, Robin Pottie, Dries Vaneechoutte, Frank Van Breusegem, Klaas Vandepoele
Pagina's: 48 - 49 - Spatiotemporal expression profile of novel and known small RNAs throughout rice plant development focussing on seed tissues(2022)
Auteurs: Aniko Meijer, Tim De Meyer, Klaas Vandepoele, Tina Kyndt
- The quest for orthologs Orthology Benchmark Service in 2022(2022)
Auteurs: Laia Codo, Elspeth A Bruford, Salvatore Cosentino, Ingo Ebersberger, Natasha Glover, Cristina Guijarro-Clarke, Mark Hickman, Tamsin E M Jones, Dushyanth Jyothi, Arnaud Kress, et al.
Pagina's: W623 - W632 - Charting plant gene functions in the multi-omics and single-cell era(2022)
Auteurs: Thomas Depuydt, Bert De Rybel, Klaas Vandepoele
Pagina's: 283 - 296 - The ÓMICAS alliance, an international research program on multi-omics for crop breeding optimization(2022)
Auteurs: Andres Jaramillo-Botero, Julian Colorado, Mauricio Quimbaya, Maria Camila Rebolledo, Mathias Lorieux, Thaura Ghneim-Herrera, Carlos A. Arango, Luis E. Tobón, Jorge Finke, Camilo Rocha, et al.
- The gene regulation knowledge commons : the action area of GREEKC(2022)
Auteurs: Martin Kuiper, Joseph Bonello, Jesualdo T. Fernández-Breis, Philipp Bucher, Matthias E. Futschik, Pascale Gaudet, Ivan V. Kulakovskiy, Luana Licata, Colin Logie, Ruth C. Lovering, et al.
- Mitotic recombination between homologous chromosomes drives genomic diversity in diatoms(2021)
Auteurs: Petra Bulánková, Mirna Sekulić, Denis Jallet, Charlotte Nef, Cock van Oosterhout, Tom O. Delmont, Ilse Vercauteren, Cristina Maria Osuna Cruz, Emmelien Vancaester, Thomas Mock, et al.
Pagina's: 3221 - 3232.e9 - Evolutionary genomics of sex-related chromosomes at the base of the green lineage(2021)
Auteurs: Luis Felipe Benites, François Bucchini, Sophie Sanchez-Brosseau, Nigel Grimsley, Klaas Vandepoele, Gwenaël Piganeau
- Comparative genomics reveals new functional insights in uncultured MAST species(2021)
Auteurs: Aurelie Labarre, David López-Escardó, Francisco Latorre, Guy Leonard, François Bucchini, Aleix Obiol, Corinne Cruaud, Michael E. Sieracki, Olivier Jaillon, Patrick Wincker, et al.
Pagina's: 1767 - 1781