Onderzoeker
Klaas Vandepoele
- Trefwoorden (Ghent University):systeembiologie, bioinformatica, Plantenbiotechnologie
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Celdood en senescentie, Invasiebiologie, Epigenomics, Auto-ecologie, Biogeografie en fylogeografie
- Disciplines (Ghent University):Ontologieën, datacuratie en text mining, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Systeembiologie niet elders geclassificeerd, Cel- en moleculaire biologie van planten, Single-cell data analyse, Analyse van next-generation sequence data, Bio-informatica en computationele biologie niet elders geclassificeerd, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie
Affiliaties
- Vandepoele Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2018 → Heden - De Veylder Lab (Onderzoeksgroep)
Lid
Vanaf1 jan 2017 → 31 dec 2017 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 dec 2000 → Heden
Infrastructuur
1 - 1 van 1
- ELIXIR België (Consortium partner)
Projecten
1 - 10 of 18
- De verborgen tuin: adaptatie en evolutie van diatomeeën in benthische habitatsVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Beoordeling van de rollen van endogene en omgevingsfactoren die de celgrootteverdeling en seksuele reproductie in benthische diatomeeënpopulaties regelenVanaf1 nov 2022 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Het in kaart brengen van functionele componenten van de diverse levenscycli in diatomeeën.Vanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele celVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Identificatie van het gen regulerende netwerken vasculaire ontwikkeling in planten - een vergelijkende benadering op single-cell resolutieVanaf1 okt 2021 → 14 okt 2022Financiering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Enzym biodiscovery-pijplijnoptimalisatie via toolbox-ontwikkelingVanaf1 sep 2021 → HedenFinanciering: VLAIO - Catalisti - cSBO
- Software ontwikkeling voor ontdekking en prioritizering van genen belangrijk voor plant-eigenschappen op basis van single-cell moleculaire profilering.Vanaf1 jun 2021 → HedenFinanciering: IOF - technologie validatie in labo
- Reproductieve barrières, interspecifieke gene flow en diversificatie in een wereldwijd voorkomende pennate diatomeeVanaf1 jan 2021 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Van modelsysteem tot gewas: een network-gebaseerde benadering voor het accuraat vertalen van biologische kennis in plantenVanaf1 okt 2019 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- ELIXIR Infrastructuur voor Data en Services om Life-Sciences Onderzoek in Vlaanderen te versterkenVanaf1 jan 2019 → 31 dec 2022Financiering: FWO Internationale onderzoeksinfrastructuur (IRI)
Publicaties
1 - 10 van 132
- Identification of growth regulators using cross-species network analysis in plants(2022)
Auteurs: Pasquale Luca Curci, Jie Zhang, Niklas Mähler, Carolin Seyfferth, Chanaka Mannapperuma, Tim Diels, Tom Van Hautegem, David Jonsen, Nathaniel Street, Torgeir R Hvidsten, et al.
Pagina's: 2350 - 2365 - Spatiotemporal expression profile of novel and known small RNAs throughout rice plant development focussing on seed tissues(2022)
Auteurs: Aniko Meijer, Tim De Meyer, Klaas Vandepoele, Tina Kyndt
- Subfunctionalization of paralog transcription factors contributes to regulation of alkaloid pathway branch choice in Catharanthus roseus(2021)
Auteurs: Maite Colinas Martinez, Jacob Pollier, Dries Vaneechoutte, Deniz Malat, Fabian Schweizer, Liesbeth De Milde, Rebecca De Clercq, Joana G. Guedes, Teresa Martínez-Cortés, Francisco Hidalgo, et al.
- Evolutionary genomics of sex-related chromosomes at the base of the green lineage(2021)
Auteurs: Luis Felipe Benites, François Bucchini, Sophie Sanchez-Brosseau, Nigel Grimsley, Klaas Vandepoele, Gwenaël Piganeau
- Inference of plant gene regulatory networks using data-driven methods : a practical overview(2020)
Auteurs: Shubhada Rajabhau Kulkarni, Klaas Vandepoele
- Light regulation of LHCX genes in the benthic diatom Seminavis robusta(2020)
Auteurs: Lander Blommaert, Emmelien Vancaester, Marie Huysman, Cristina Maria Osuna Cruz, Sofie D'hondt, Johann Lavaud, Bernard Lepetit, Per Winge, Atle M. Bones, Klaas Vandepoele, et al.
- Virus-host coexistence in phytoplankton through the genomic lens(2020)
Auteurs: Sheree Yau, Marc Krasovec, L. Felipe Benites, Stephane Rombauts, Mathieu Groussin, Emmelien Vancaester, Jean-Marc Aury, Evelyne Derelle, Yves Desdevises, Marie-Line Escande, et al.
- Neoproterozoic origin and multiple transitions to macroscopic growth in green seaweeds(2020)
Auteurs: Andrea Del Cortona, Christopher J. Jackson, François Bucchini, Michiel Van Bel, Sofie D'hondt, Pavel Skaloud, Charles F. Delwiche, Andrew H. Knoll, John A. Raven, Heroen Verbruggen, et al.
Pagina's: 2551 - 2559 - The Seminavis robusta genome provides insights into the evolutionary adaptations of benthic diatoms (vol 11, 3320, 2020)(2020)
Auteurs: Cristina Maria Osuna Cruz, Gust Bilcke, Emmelien Vancaester, Sam De Decker, Atle M. Bones, Per Winge, Nicole Poulsen, Petra Bulánková, Bram Verhelst, Sien Audoor, et al.
- A new evolutionary model for the vertebrate actin family including two novel groups(2019)
Auteurs: Laura Witjes, Marleen Van Troys, Joël Vandekerckhove, Klaas Vandepoele, Christophe Ampe