Onderzoeker
Joost Schymkowitz
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Analyse van next-generation sequence data, Celdood, Gedragsneurowetenschappen
- Disciplines (KU Leuven):Proteïnen, Bio-informatica van ziekten, Structurele bio-informatica en computationele proteomics, Synthetische biologie, Proteomics
Affiliaties
- Switch Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2017 → Heden - Switch Laboratorium (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 jan 2011 → Heden - Departement Cellulaire en Moleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf15 sep 2010 → 31 dec 2010
Infrastructuur
1 - 1 van 1
- Wanneer grootte ertoe doet: een platform om moleculaire interacties en multimerisatie te bestuderen (Consortium coordinator)
Projecten
11 - 20 of 54
- Co-translationele aggregatie en de cellulaire factoren die het voorkomenVanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Rationeel ontwerp van biologische geneesmiddelen voor therapeutische ontwikkeling (FoldCo)Vanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: FWO Strategisch Basisonderzoek (SBO)
- Rationeel ontworpen peptidesondes die radionucliden helpen richten op tumoren die Hsp90 tot expressie brengenVanaf22 jun 2021 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- lading-voorkeur van het Zoogdier eiwit kwaliteitscontrole mechanismeVanaf19 mrt 2021 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Onderzoek naar de rol van tau-aggregaten in neurodegeneratieVanaf15 feb 2021 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Ontrafeling van de conformatie en oligomerisatie-eigenschappen van proteïne Tau: Aanzet tot innovatieve therapeutische, prognostische en diagnostische strategieënVanaf1 jan 2021 → 31 dec 2023Financiering: IOF - technologie validatie in labo
- Onderzoek naar de proteostatische ineenstorting veroorzaakt door aggregatie-inducerende bacteriedodende peptidenVanaf1 nov 2020 → HedenFinanciering: FWO senior postdoctoraal mandaat
- Een compleet model voor eiwit aggregatie en zijn toepassing op het ontwerp van monoclonale antilichamen en peptides voor doelgerichte aggregatieVanaf1 okt 2020 → 30 sep 2021Financiering: BOF - postdoctorale mandaten
- Een 200 kV Transmissie Elektronenmicroscoop voor bepaling van de 3D-ultrastruktuur van eiwitten, cellen en weefsel in hun oorspronkelijke staat.Vanaf1 mei 2020 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Kristallografische faciliteit voor doelgericht medicijnontwerpVanaf1 mei 2020 → HedenFinanciering: FWO Internationale onderzoeksinfrastructuur (IRI)
Publicaties
1 - 10 van 159
- Integrating physics in deep learning algorithms: a force field as a PyTorch module.(2024)
Auteurs: Joost Schymkowitz, Frederic Rousseau
Pagina's: btae160 - Local structural preferences in shaping tau amyloid polymorphism(2024)
Auteurs: Grigoria Tsaka, Rodrigo Gallardo, Dietmar Thal, Frederic Rousseau, Joost Schymkowitz
- N-glycosylation as a eukaryotic protective mechanism against protein aggregation.(2024)
Auteurs: Bert Houben, Matthias De Vleeschouwer, Matthew Wilson, Gert Matthijs, Joost Schymkowitz, Frederic Rousseau
Pagina's: eadk8173 - Modulation of hen egg white protein techno-functionality by amyloid formation(2024)
Auteurs: Anja Vananroye, Paula Moldenaers, Joost Schymkowitz, Frederic Rousseau, Jan Delcour
- LRRC37B is a human modifier of voltage-gated sodium channels and axon excitability in cortical neurons(2023)
Auteurs: Sofie Beckers, Katerina Konstantoulea, Maarten Dewilde, Frederic Rousseau, Joost Schymkowitz, Tom Theys, Joris de Wit, Pierre Vanderhaeghen
- Mechanisms and pathology of protein misfolding and aggregation(2023)
Auteurs: Nikolaos Louros, Joost Schymkowitz, Frederic Rousseau
Pagina's: 912 - 933 - Improved coalescence and creaming stability of structured oil-in-water emulsions and emulsion gels containing ovalbumin amyloid-like fibrils produced by heat and enzymatic treatments(2023)
Auteurs: Frederic Rousseau, Joost Schymkowitz, Jan Delcour
- TDP‑43 pathology is associated with increased tau burdens and seeding(2023)
Auteurs: Sandra Oliveira Tomé, Grigoria Tsaka, Klara Gawor, Philip Van Damme, Ludo Van Den Bosch, Rik Vandenberghe, Frederic Rousseau, Joost Schymkowitz, Dietmar Thal
- Exploiting the aggregation propensity of beta-lactamases to design inhibitors that induce enzyme misfolding(2023)
Auteurs: Laleh Khodaparast, Ladan Khodaparast, Emiel Michiels, Rodrigo Gallardo, Bert Houben, Frederic Rousseau, Joost Schymkowitz
- Amyloid-like p53 as prognostic biomarker in serous ovarian cancer-a study of the OVCAD consortium(2023)
Auteurs: Ignace Vergote, Toon Van Gorp, Frederic Rousseau, Joost Schymkowitz
Pagina's: 2473 - 2484
Patenten
1 - 10 van 10
- Molecules targeting ras protein (Inventor)
- Molecules targeting proteins (Inventor)
- Molecules targeting mutant ras protein (Inventor)
- Beta-lactamase inhibitors (Inventor)
- Carbon dioxide generation (Inventor)
- Molecules targeting mutant ras protein (Inventor)
- Means and methods for the prediction of amyloid core sequences (Inventor)
- Molecules targeting proteins (Inventor)
- Molecules targeting ras protein (Inventor)
- Carbon dioxide generation (Inventor)