Onderzoeker
Jo Vandesompele
- Trefwoorden:DNA, Niet-coderend RNA, vloeibare biopsie, kanker, RNA, PCR, Toegepaste bio-informatica, DNA en RNA sequenering
- Disciplines:Kankerdiagnose, Kankerpreventie, Kankerepidemiologie, Kankerbiologie, Kankertherapie, Analyse van next-generation sequence data, Bio-informatica van ziekten, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie, Datavisualisatie en high-throughput beeldanalyse, Ontologieën, datacuratie en text mining, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Klinische genetica en moleculaire diagnostiek, Oncologie niet elders geclassificeerd, Medische epigenomics, Medische metagenomics, Medische genomics, Single-cell data analyse, Bio-informatica en computationele biologie niet elders geclassificeerd, Structurele bio-informatica en computationele proteomics
Affiliaties
- Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → Heden - Vakgroep Pediatrie en genetica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 1997 → 30 sep 2018
Projecten
21 - 30 of 32
- Lange niet-coderende RNAs in kanker: ontrafelen van de donkere materie van het kankergenoomVanaf1 jan 2016 → 31 dec 2022Financiering: BOF - Geconcert. Onderzoeksacties vanaf 1994
- beurs Anneleen Decock: Exploratie van het neuroblastoom-DNA-methyloom: identificatie van verschillen tussen biologische subgroepen en optimalisatie van biomerkerdetectie in plasma.Vanaf1 okt 2015 → 30 sep 2016Financiering: FWO Humanitair onderzoeksproject Kom op tegen kanker
- Decoderen lange niet-coderende RNA's in kanker - Stichting tegen kankerVanaf1 jan 2015 → 31 dec 2018Financiering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- LncRNAs als therapeutische targets en diagnostische biomerkers voor geavanceerde melanomaVanaf1 apr 2014 → 30 jun 2016Financiering: IOF - Industrieel Onderzoeksfonds
- Verbeterde uitkomst voorspelling van kinderen met neuroblastoom met behulp van een geïntegreerde m/miRNA en DNA-methylatie handtekening (Stichting tegen Kanker)Vanaf1 jan 2013 → 31 dec 2022Financiering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- Geïntegreerde - biologie gedreven diagnostische en therapeutische behandeling van neuroblastoom (Stichting tegen Kanker)Vanaf1 jan 2013 → 31 dec 2015Financiering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- Identificatie en functionele analyse van TP53 netwerk lange niet-coderende RNA genen in kankerVanaf1 okt 2012 → 1 okt 2014Financiering: BOF - Andere acties
- Ontwikkeling en toepassing van digitale PCRVanaf15 jun 2012 → 30 jun 2016Financiering: BOF - Andere acties
- Menselijke exome resequencing PCR testontwerpVanaf15 apr 2012 → 14 okt 2013Financiering: IOF - Industrieel Onderzoeksfonds
- Moleculaire fenotypering en in vivo karakterisatie van microRNA perturbatie in neuroblastoomVanaf30 dec 2010 → 30 dec 2014Financiering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
Publicaties
1 - 10 van 120
- Nationwide quality assurance of high-throughput diagnostic molecular testing during the SARS-CoV-2 pandemic : role of the Belgian National Reference Centre(2024)
Auteurs: Reile Janssen, Lize Cuypers, Lies Laenen, Els Keyaerts, Kurt Beuselinck, Sunita Janssenswillen, Bram Slechten, Jannes Bode, Elke Wollants, Kristel Van Laethem, et al.
- HTSplotter : an end-to-end data processing, analysis and visualisation tool for chemical and genetic in vitro perturbation screening(2024)
Auteurs: Carolina de Carvalho Nunes, Jasper Anckaert, Fanny De Vloed, Jolien De Wyn, Kaat Durinck, Jo Vandesompele, Franki Speleman, Vanessa Vermeirssen
- Nucleic acid degradation as barrier to gene delivery : a guide to understand and overcome nuclease activity(2024)
Auteurs: Heyang Zhang, Jo Vandesompele, Kevin Braeckmans, Stefaan De Smedt, Katrien Remaut
Pagina's: 317 - 360 - Blocking abundant RNA transcripts by high-affinity oligonucleotides during transcriptome library preparation(2023)
Auteurs: Celine Everaert, Jasper Verwilt, Kimberly Verniers, Niels Vandamme, Alvaro Marcos Rubio, Jo Vandesompele, Pieter Mestdagh
- Performance evaluation of RNA purification kits and blood collection tubes in the Extracellular RNA Quality Control (exRNAQC) study(2023)
Auteurs: Anneleen Decock, Olivier De Wever, Celine Everaert, Hetty Helsmoortel, An Hendrix, Pieter Mestdagh, Annelien Morlion, Jo Vandesompele, Ruben Van Paemel, Francisco Avila Cobos, et al.
Aantal pagina's: 1 - Performance evaluation of RNA purification kits and blood collection tubes in the Extracellular RNA Quality Control (exRNAQC) study(2023)
Auteurs: Anneleen Decock, Olivier De Wever, Celine Everaert, Hetty Helsmoortel, An Hendrix, Pieter Mestdagh, Annelien Morlion, Jo Vandesompele, Ruben Van Paemel, Francisco Avila Cobos, et al.
Aantal pagina's: 1 - Large-scale benchmarking of circRNA detection tools reveals large differences in sensitivity but not in precision(2023)
Auteurs: Marieke Vromman, Jasper Anckaert, Stefania Bortoluzzi, Alessia Buratin, Chia-Ying Chen, Qinjie Chu, Trees-Juen Chuang, Roozbeh Dehghannasiri, Christoph Dieterich, Xin Dong, et al.
Pagina's: 1159 - 1169 - Exploring the cell-free total RNA transcriptome in diffuse large B-cell lymphoma and primary mediastinal B-cell lymphoma patients as biomarker source in blood plasma liquid biopsies(2023)
Auteurs: Philippe Decruyenaere, Edoardo Giuili, Kimberly Verniers, Jasper Anckaert, Katrien De Grove, Malaïka Van der Linden, Dries Deeren, Jo Van Dorpe, Fritz Offner, Jo Vandesompele
- Circular RNA detection pipelines yield divergent sets of circular RNAs(2023)
Auteurs: Marieke Vromman, Jo Vandesompele
Pagina's: 1135 - 1136 - Exploration of neuroblastoma xenograft models for tumor extracellular RNA profiling in murine blood plasma(2023)
Auteurs: Jill Deleu, Hanne Van Droogenbroeck, Jasper Anckaert, Anneleen Decock, Jilke De Wilde, Kaat Durinck, Liselot Mus, Justine Nuytens, Muhammad Rishfi, Kathleen Schoofs, et al.
Patenten
1 - 6 van 6
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma (Inventor)
- Biomarkers for disease burden of neuroblastoma (Inventor)
- Usages of recombinant extracellular vesicles (Inventor)
- Biomarkers for disease burden of neuroblastoma (Inventor)
- Usages of recombinant extracellular vesicles (Inventor)
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma (Inventor)