Onderzoeker
Jo Vandesompele
- Trefwoorden:DNA, Niet-coderend RNA, vloeibare biopsie, kanker, RNA, PCR, Toegepaste bio-informatica, DNA en RNA sequenering
- Disciplines:Kankerdiagnose, Kankerpreventie, Kankerepidemiologie, Kankerbiologie, Kankertherapie, Analyse van next-generation sequence data, Bio-informatica van ziekten, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie, Datavisualisatie en high-throughput beeldanalyse, Ontologieën, datacuratie en text mining, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Klinische genetica en moleculaire diagnostiek, Oncologie niet elders geclassificeerd, Medische epigenomics, Medische metagenomics, Medische genomics, Single-cell data analyse, Bio-informatica en computationele biologie niet elders geclassificeerd, Structurele bio-informatica en computationele proteomics
Affiliaties
- Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → Heden - Vakgroep Pediatrie en genetica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 1997 → 30 sep 2018
Projecten
1 - 10 of 32
- Ontwikkeling van methodes voor de quantificatie van nucleïnezuren in functionele genomica in kankerVanaf16 sep 2023 → 15 jan 2024Financiering: BOF - doctorale mandaten
- ITN-PrIOMiCVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: BOF - mobiliteit
- 6-kleuren digitaal PCR toestelVanaf15 dec 2022 → HedenFinanciering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Elke cel telt! Het transformeren van bewegingswetenschappen door middel van transcriptoom analyse van een enkele menselijke spiervezelVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Celvrij-nucleïnezuurprofilering in diffuus grootcellig B-cellymfoom: een moleculaire leidraad voor precisiegeneeskundeVanaf1 okt 2022 → 31 okt 2022Financiering: BOF - doctorale mandaten
- Replicatievork protectiefactoren als nieuwe doelwitten voor ombinatietherapie en immunomodulering (REINFORCE)Vanaf1 jan 2022 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Ontwikkeling van een laboratorium 'gereedschapskist' om humane circulaire RNAs te bestuderenVanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- De biologie van tumoraal extracellulair RNA in vloeibare bioptenVanaf1 nov 2020 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Kankerspecifieke circulerende RNAs als biomerkers voor diagnose en opvolging van therapieresponsVanaf1 nov 2020 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Het analyseren van circulerende bacteriële extracellulaire vesikels in kankerpatiënten om hun samenstelling en biomarker potentieel te identificeren.Vanaf1 nov 2020 → 31 mrt 2023Financiering: FWO mandaten
Publicaties
11 - 20 van 120
- Dramatic impact of blood collection tube and RNA purification method on extracellular RNA transcriptomes(2023)
Auteurs: Jasper Anckaert, Francisco Avila Cobos, Anneleen Decock, Philippe Decruyenaere, Jill Deleu, Katleen De Preter, Olivier De Wever, Jilke De Wilde, Bert Dhondt, Thibaut D'huyvetter, et al.
Aantal pagina's: 1 - Longitudinal evaluation of serum microRNAs as biomarkers for neuroblastoma burden and therapeutic p53 reactivation(2023)
Auteurs: Alan Van Goethem, Jill Deleu, Nurten Yigit, Celine Everaert, Myrthala Moreno-Smith, Sanjeev A Vasudevan, Fjoralba Zeka, Eveline Barbieri, Franki Speleman, Pieter Mestdagh, et al.
- Evaluation of efficiency and sensitivity of 1D and 2D sample pooling strategies for SARS-CoV-2 RT-qPCR screening purposes(2022)
Auteurs: Jasper Verwilt, Jan Hellemans, Tom Sante, Pieter Mestdagh, Jo Vandesompele
- Whole transcriptome profiling of liquid biopsies from tumour xenografted mouse models enables specific monitoring of tumour-derived extracellular RNA(2022)
Auteurs: Vanessa Vermeirssen, Jill Deleu, Annelien Morlion, Celine Everaert, Jilke De Wilde, Jasper Anckaert, Kaat Durinck, Justine Nuytens, Muhammad Rishfi, Franki Speleman, et al.
- Whole transcriptome profiling of liquid biopsies from tumor xenografted mouse models enables specific monitoring of tumor-derived RNA(2022)
Auteurs: Vanessa Vermeirssen, Jill Deleu, Annelien Morlion, Celine Everaert, Kimberly Verniers, Tom Van Maerken, Bram De Wilde, Jo Vandesompele, Anneleen Decock
Aantal pagina's: 1 - Whole transcriptome profiling of liquid biopsies from tumor xenografted mouse models enables specific monitoring of tumor-derived RNA(2022)
Auteurs: Vanessa Vermeirssen, Jill Deleu, Annelien Morlion, Celine Everaert, Kimberly Verniers, Tom Van Maerken, Bram De Wilde, Jo Vandesompele, Anneleen Decock
Aantal pagina's: 1 - Digital PCR-based evaluation of nucleic acid extraction kit performance for the co-purification of cell-free DNA and RNA(2022)
Auteurs: Jill Deleu, Kathleen Schoofs, Anneleen Decock, Kimberly Verniers, Sofie Roelandt, Angie Denolf, Joke Verreth, Bram De Wilde, Tom Van Maerken, Katleen De Preter, et al.
- Whole transcriptome profiling of liquid biopsies from tumor xenografted mouse models enables specific monitoring of tumor-derived RNA(2021)
Auteurs: Vanessa Vermeirssen, Jill Deleu, Celine Everaert, Annelien Morlion, Kimberly Verniers, Jasper Anckaert, Jo Vandesompele, Tom Van Maerken, Anneleen Decock, Bram De Wilde
Aantal pagina's: 1 - Substantial performance differences among RNA purification kits and blood collection tubes in the Extracellular RNA Quality Control (exRNAQC) study(2021)
Auteurs: Anneleen Decock, Olivier De Wever, Celine Everaert, Hetty Helsmoortel, An Hendrix, Pieter Mestdagh, Annelien Morlion, Jo Vandesompele, Ruben Van Paemel, Francisco Avila Cobos, et al.
Aantal pagina's: 1 - Validation of circular RNAs using RT‐qPCR after effective removal of linear RNAs by ribonuclease R(2021)
Auteurs: Marieke Vromman, Nurten Yigit, Kimberly Verniers, Steve Lefever, Jo Vandesompele, Pieter-Jan Volders
Patenten
1 - 6 van 6
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma (Inventor)
- Biomarkers for disease burden of neuroblastoma (Inventor)
- Usages of recombinant extracellular vesicles (Inventor)
- Biomarkers for disease burden of neuroblastoma (Inventor)
- Usages of recombinant extracellular vesicles (Inventor)
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma (Inventor)
Gelinkte datasets
1 - 1 van 1