< Terug naar vorige pagina

Onderzoeker

Annemieke Smet

  • Onderzoeksexpertise:Ontrafelen van het mucine mRNA isovorm landschap en de alternatieve splicing machinerie bij barrière-gerelateerde ziekten. Studie naar de rol van mucine mRNA isovorm signaling pathways die betrokken zijn in de verstoring van de mucosale barrière bij gastro-intestinale aandoeningen (inflammatoire darmziekten (IBD), maag- en colorectale kankers) en luchtwegaandoeningen (RSV, COVID-19 en COPD). Onderzoek naar de interactie tussen mucines (en hun mRNA isovormen) en de microbiota in relatie tot een verstoorde mucosale barrière bij gastro-intestinale aandoeningen (IBD en kanker) word ook bestudeerd. We implementeren een onconventionele aanpak die gebruik maakt van high throughput next-generation (long-read en short-read) sequencing technologieën, collecties van patiënten stalen en translationele modellen (organoïden en diermodellen) met als doel het vinden van nieuwe behandelingsstrategieën en/of biomerkers voor diagnostiek en opvolging van ziekte.
  • Trefwoorden:ONTSTEKING, CELBIOLOGIE, Diergeneeskunde
  • Disciplines:Gastro-enterologie en hepatologie, Gastro-enterologie, Inflammatie, Laboratoriumgeneeskunde, Bacteriologie, Infectieziekten, Microbioom, Cellulaire signaaltransmissie, Membraanstructuur en -transport, Kankerbiologie, Pathofysiologie, Kankerdiagnose, Kankertherapie
  • Onderzoekstechnieken:- in vitro celculturen: * maag- en darmkanker cellijnen * primaire celculturen * organoid culturen - in vivo muismodellen voor het bestuderen van gastro-intestinale aandoeningen: * Helicobacter pylori-gerelateerd maagkanker model (C56BL/6 model) * Dextraan sodium sulfaat (DSS) colitis model (C57BL/6 model) * T cel tranfer colitis model (SCID model) * Helicobacter hepaticus colitis model (C57BL/6 model) - transfection (siRNA) and transduction (shRNA) experimenten: gene silencing - permeabiliteitsexperimenten: transwell, FITC dextraan en Ussing chamber technieken - moleculaire biologie: gen- en eiwit expressie analyses (RT-qPCR, Western blotting, ELISA, immunohistochemie) - microbiomics and transcriptomics : Illumina and PacBio sequencing platformen
  • Gebruikers van onderzoeksexpertise:wetenschappers betrokken in het basis en translationeel onderzoek farmaceutische en biotech bedrijven