Onderzoeker
Andries De Koker
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Analytische biochemie, Celdood en senescentie, Analyse van next-generation sequence data, Algemene diagnostiek
- Disciplines (Ghent University):Kankerdiagnose, Bioinformatica
Affiliaties
- Callewaert Lab (Onderzoeksgroep)
Lid
Vanaf1 jan 2017 → 31 dec 2021 - Vakgroep Biochemie en Microbiologie (Departement)
Lid
Vanaf12 sep 2013 → Heden
Projecten
1 - 2 of 2
- cfRRBS: vertaling van technologische vooruitgang in methyleringsprofilering van circulerend celvrij DNA voor minimaal invasieve classificatie en recidiefdetectie van hooggradig lymfoom.Vanaf1 jan 2022 → HedenFinanciering: VZW en equivalenten
- Nieuwe methodologie voor voorwaartse genetica screenings in humane HEK293 cellenVanaf1 okt 2013 → 30 sep 2017Financiering: BOF - Andere acties, FWO mandaten
Publicaties
1 - 10 van 11
- Computational deconvolution of DNA methylation data from mixed DNA samples(2024)
Auteurs: Maísa Renata Ferro Dos Santos, Edoardo Giuili, Andries De Koker, Celine Everaert, Katleen De Preter
- The feasibility of using liquid biopsies as a complementary assay for copy number aberration profiling in routinely collected paediatric cancer patient samples(2022)
Auteurs: Ruben Van Paemel, Charlotte Vandeputte, Lennart Raman, Leen Willems, Jo Van Dorpe, Malaïka Van der Linden, Jilke De Wilde, Andries De Koker, Björn Menten, Christine Devalck, et al.
Pagina's: 12 - 23 - GENType : all-in-one preimplantation genetic testing by pedigree haplotyping and copy number profiling suitable for third-party reproduction(2022)
Auteurs: Lisa De Witte, Lennart Raman, Machteld Baetens, Andries De Koker, Nico Callewaert, Sofie Symoens, Kelly Tilleman, Frauke Vanden Meerschaut, Annelies Dheedene, Björn Menten
Pagina's: 1678 - 1691 - Genome-wide study of the effect of blood collection tubes on the cell-free DNA methylome(2021)
Auteurs: Ruben Van Paemel, Andries De Koker, Christa Caggiano, Annelien Morlion, Pieter Mestdagh, Bram De Wilde, Jo Vandesompele, Katleen De Preter
Pagina's: 797 - 807 - Minimally invasive classification of pediatric solid tumors using reduced representation bisulfite sequencing of cell-free DNA : a proof-of-principle study(2021)
Auteurs: Ruben Van Paemel, Andries De Koker, Charlotte Vandeputte, Lieke van Zogchel, Tim Lammens, Genevieve Laureys, Jo Vandesompele, Gudrun Schleiermacher, Mathieu Chicard, Nadine Van Roy, et al.
Pagina's: 196 - 208 - Minimally invasive classification of pediatric solid tumors using reduced representation bisulfite sequencing of cell-free DNA(2020)Volume: 26
Auteurs: Ruben Van Paemel, Andries De Koker, Charlotte Vandeputte, Lieke Van Zogchel, Tim Lammens, Genevieve Laureys, Jo Vandesompele, Gudrun Schleiermacher, Matthieu Chicard, Nadine Van Roy, et al.
Pagina's: 93 - 93 - Successful copy number alteration profiling using circulating cell-free tumor DNA as a non-invasive alternative for tissue biopsies in pediatric cancer patients(2019)
Auteurs: Charlotte Vandeputte, Jolien Van Thorre, Ruben Van Paemel, Andries De Koker, Leen Willems, Jo Van Dorpe, Malaïka Van der Linden, Jilke De Wilde, Björn Menten, Lieke van Zogchel, et al.
Aantal pagina's: 1 - Shallow whole genome sequencing on circulating cell-free DNA in pediatric cancer patients(2019)Volume: 66
Auteurs: Charlotte Vandeputte, Jolien Van Thorre, Ruben Van Paemel, Andries De Koker, Leen Willems, Jo Van Dorpe, Malaïka Van der Linden, Jilke De Wilde, Björn Menten, L. van Zogchel, et al.
Pagina's: S505 - S506 - Novel methods designed for diagnostic methylome profiling of blood circulating cell-free DNA : expanding the liquid biopsy molecular toolbox(2019)
Auteurs: Andries De Koker
- Faster, cheaper and more accurate diagnosis of cancer of unknown primary (CUP) by using methylation profiling.(2019)
Auteurs: Jilke De Wilde, Ruben Van Paemel, Charlotte Vandeputte, Andries De Koker, Joni Van der Meulen, Malaïka Van der Linden, Nico Callewaert, Jo Van Dorpe, David Creytens, Bram De Wilde, et al.
Aantal pagina's: 1
Patenten
1 - 4 van 4