< Terug naar vorige pagina

Onderzoeker

Alfonso Gerardo Garcia

  • Onderzoeksdoeleinden:Onderzoek gericht op neurodegeneratieve ziekten met behulp van in vivo en in vitro modellen met specifieke ervaring in integratie en analyses van grote gegevenssets en de interactie van complexe systemen op genetisch, eiwit- en functioneel niveau door het gebruik van -omics, geavanceerde microscopische en moleculaire biologische technieken evenals neuronale netwerkanalyses.
  • Trefwoorden:BEELDANALYSE, ZIEKTE VAN ALZHEIMER, SYNAPS, NEUROGENETICA, NEURODEGENERATIE, NEUROBIOLOGIE, LEVENDECEL-BEELDVORMING, ZIEKTE VAN HUNTINGTON, Farmacie
  • Disciplines:Ontdekking en evaluatie van biomarkers, Ontdekking en evaluatie van geneesmiddelen, Medicinale chemie, Medicinale producten, Farmaceutische analyse en kwaliteitszorg, Farmaceutica, Farmacognosie en fytochemie, Farmacologie, Farmacotherapie, Toxicologie en toxinologie, Andere farmaceutische wetenschappen, Andere medische en gezondheidswetenschappen
  • Onderzoekstechnieken:LaboratoriumtechniekenFundamentele moleculaire biologieprotocollen - DNA-RNA-extractie, Maxi-Mini preps, PCR, muriene hersendissectie, eiwitextractie, Western-blotting.Immunokleuringstechnieken - Immunohisto (& cyto) chemie, immunofluorescentie, Proximity Ligation Assay.Celcultuurtechnieken - Primaire neuronale culturen (striataal, corticaal en hippocampaal), onderhoud van standaard cellijnculturenMicroscopietechnieken - hoge doorvoer Confocale microscopie & epifluorescentiemicroscopie, Calcium Live Imaging voor neuronale activiteit (uitgebreide ervaring).Beoordeling functionele diermodellen - Cognitieve tests (T-Maze, NORT, NOLT), Motortests (Rotarod, Balance Beam), Angststests (Plus-Maze)Diermodel interventietechnieken - stereotaxische chirurgie, standaard histologische technieken (perfusie, aseptische chirurgische technieken, enz.)Computationele en bioinformatica vaardighedenWetenschappelijke database zoeken - (pubmed, NIH, Thomson Reuters), gespecialiseerde wetenschappelijke database: Allen Brain Atlas, Brainspan, Genomic-zoekopdrachten in Ensembl, USCS, enz.Batch imaging processing - ImageJ, Imagemagick scripting, CellProfiler (zie publicaties Miguez et al. 2015), aCapella software (PerkinElmer), Matlab scripting van beeldmanipulatie, Calcium Live imaging beeldverwerking (signaalanalyses), breed scala aan standaard Image Software analyses door Leica , Hammamatsu, Olympus, etc.Bio-informatica met betrekking tot data-analyses - R-programmering toegepast op: Microarray en RNA-seq-analyses, (Rsubread, Limma), gewogen gencorrelatienetwerkanalyses (WGCNA), monocle-analyses van single cell RNA-seq. Visualisatiehulpmiddelen voor genomische en transcriptomische gegevens: Genesis-software, gplot in R, IGV Genomic viewer. Gene ontologie verrijkingsanalyses. Thomson Reuters ’Metacore ™ -software voor genomische netwerkanalyses op beheerde databases, Cytoscape. Hoge doorvoersnelheid Beeldgegevensanalyses in R en Matlab (Deep dekking microscopie, live Ca ++ Imaging, ImageJ)Algemene computationele vaardigheden - Basis programmeerervaring in C +, Java, Matlab. Batch scripting voor Windows en Linux. Top-level gebruiker van Windows, geavanceerde gebruiker in Linux en MacO's. Computer assemblage en reparatie. Hoofdgebruiker Office-gebruiker (Microsoft, OpenOffice). Geavanceerde gebruiker in grafische ontwerpsoftware (GIMP, Inkscape, Photoshop)
  • Gebruikers van onderzoeksexpertise:Beeldanalysegroepen, geavanceerde microscopiegroepen, gegevensanalyses, neurodegeneratieve ziekten, de ziekte van Huntington, de ziekte van Alzheimer, de ziekte van Parkinson, moleculaire neurowetenschap, synapsstudiegroepen