Intrabacterieel geneesmiddel metabolisme in Mycobacterium tuberculosis

Met behulp van metbolomics gaan we het intrabacterieel geneesmiddelenmetabolisme (IBDM) in Mycobacterium tuberculosis bestuderen en de betrokken cellulaire netwerken identificeren. Naast metabolomics, willen we IBDM ook bestuderen vanuit een genomics benadering om zo inzicht te krijgen in de genen die geassocieerd zijn met IBDM. Verder zullen CRISPR technieken zoals CRISPRi en CRISPRa gebruikt worden om knockdown en overexpressiestammen te genereren van de genen geassocieerd met IBDM. In deze stammen zal het metabolisme van geneesmiddelen worden geëvalueerd om de link tussen genfunctie en IBDM te valideren. Daarnaast willen we IBDM vergelijken tussen verschillende klinische isolaten van Mtb om meer inzicht te krijgen in de klinische relevantie van onze bevindingen.