Identificatie van T celreceptoren voor de ontwikkeling van nieuwe anti-leukemie therapieën

Het doel van dit project is om een robuuste workflow the ontwikkelen voor de identificatie van veelbelovende T cell receptoren (TCRs) in de ontwikkeling van T cell gebaseerde immuuntherapieën. De focus ligt op het leukemie geassocieerde Willm's tumor-1 (WT1) antigen. Hiervoor is een unieke collectie van bloedstalen beschikbaar van patiënten met acute myeloïde leukemie (AML). Deze werden verzameld in de context van onze academische klinische onderzoeken die het effect van dendritische celvaccinatie (DC vaccinatie) onderzoeken waarbij de DCs geladen zijn met WT1 mRNA. Deze immuuntherapie is ontwikkeld om WT1-specifieke T cellen te activeren. Door gespecialiseerde cel sortering technieken te combineren met zelf ontwikkelde bioinformatica methoden zullen we single-cell TCR en RNA sequenering integreren met unieke computationele modellen ten einde de specificiteit en de transcriptomische profielen van deze T cellen te linken met de klinische response van de patiënten.

Trefwoorden:T CYTOTOXISCHE LYMFOCYTEN, KANKERTHERAPIE, BIO-INFORMATICA, SEQUENCING

Disciplines:Computationele biomodellering en machine learning, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Single-cell data analyse, Toegepaste immunologie, Kankertherapie