< Terug naar vorige pagina

Project

Van Y-chromosoom naar microbioom: een interdisciplinaire verwantschapsstudie

Zowel binnenin als vanbuiten huisvest ons lichaam een grote diversiteit aan micro-organismen, genaamd ons microbioom. Volgens onderzoek lijkt het microbioom van familieleden meer op elkaar dan dat van niet-familieleden. Het is echter niet duidelijk of dit wordt veroorzaakt door hun gelijkaardig DNA of gedeelde omgeving. Via het mannelijk Y-chromosoom (chrY) kunnen we dicht, ver en evolutionair verwante mannen identificeren. Ons nieuw sequencing panel, de CSYseq, is het eerste panel dat zowel familiale als evolutionaire verwantschappen identificeert. Met dit interdisciplinaire project wil ik de associatie tussen gastheergenetica en het microbioom bestuderen via uitgebreide stambomen in de vaderlijke lijn. Daarvoor zal ik het microbioom en menselijk DNA van 210 mannen uit de Lage Landen diepgaand sequencen. Het is mijn ambitie om nieuwe en waardevolle perspectieven te bieden binnen twee disciplines: Evolutionaire Biologie en Forensische Genetica. Door deze interdisciplinaire benadering zal ik (a) het verband tussen het microbioom en gastheergenetica onthullen, (b) de invloed van verwantschapsgraad en geografie op de microbioom erfelijkheidsgraad ontrafelen, en (c) de toepassing van microbioom analyse en CSYseq evalueren in een forensische context. Het belangrijkste resultaat is een genetische genealogische database, die chrY koppelt aan microbioom data. Deze pioniersstudie zal het belang van microbioom en genetica voor interdisciplinair populatieonderzoek wereldwijd vergroten.

Datum:1 nov 2022 →  Heden
Trefwoorden:Y-chromosomal DNA, Microbiomics, Paternal kinships
Disciplines:Computationele evolutionaire biologie, comparatieve genomics en populatiegenomics, Fylogenie en vergelijkende analyse, Populatie, ecologische en evolutionaire genetica, Microbiomen, Genetica, Forensische biologie
Project type:PhD project