Crosslinkende Aptameren voor Covalente Proteïne Targeting

Aptameren zijn enkelstrengige nucleïnezuurliganden die bepaalde doelwitten kunnen binden met hoge affiniteit en selectiviteit, dankzij hun karakteristieke driedimensionale structuur. Omwille van deze functionaliteiten zijn aptameren veelvuldig onderzocht in verschillende toepassingen, zoals doelwitgerichte therapie, celkleuring en biosensoren. Desondanks is het gebruik van aptameren in de dagelijkse praktijk heel beperkt, waardoor nog verder onderzoek, ontwikkeling en optimalisatie nodig is om aptameren therapeutisch en diagnostisch toegankelijk te maken. Dit project heeft als doel de chemie van aptameren uit te breiden naar aptameren die selectief een celoppervlakte-eiwit kunnen crosslinken. Furaan-gemodificeerde nucleosiden zullen in bestaande aptameer sequenties ingebouwd worden, zowel synthetisch als enzymatisch voor de aanmaak van aptameren met een milde tot hoge complexiteit respectievelijk. De furaan technologie uitgewerkt door de OBCR groep zorgt voor tijdruimtelijke controle van de crosslinkreactie, aangezien enkel geactiveerd furaan covalente bindingen kan vormen met zijn doelwit. Selectieve activatie wordt gerealiseerd door singlet zuurstof, gegenereerd bij lichtirradiatie van een fotosensitizer, of reactieve zuurstofverbindingen geproduceerd ter hoogte van het celoppervlak. De specificiteit van aptameren zal worden gecombineerd met de selectiviteit van de furaantechnologie om aptameren te maken met hoge affiniteit die covalent celoppervlakte-eiwitten binden.