Een spatiale multi-omics aanpak om de vroegste klonale achterliggende veranderingen van hoofd- en hals tumoren te bepalen.

Somatische mutaties zijn kleine DNA-fouten die zich opstapelen in het genoom van verouderende cellen. Soms leiden deze mutaties tot een groeivoordeel in de aangetaste cellen, vooral in kankergenen. De accumulatie van meerdere zogenaamde ‘aansturende mutaties’ kan uiteindelijk leiden tot het ontstaan van kwaadaardige tumoren. Recente inzichten in de vroegste ontwikkelingsstadia van tumoren tonen aan dat deze mutaties ook in histologisch normale weefsels de vorming van microscopische klonen aandrijven. Ondanks de hoge incidentie van hoofd en hals (HH) tumoren is er niets geweten over de mutationele klonaliteit in HH weefsel. Het doel is om de somatische mutaties in de HH regio te karakteriseren in post-mortem HH weefsels verkregen vanuit lichaamsdonoren met gekoppelde klinische gegevens, gebruik makende van een methodologie die we recent hebben ontwikkeld. We zullen diep-exoom sequencing gebruiken om HH mutationele klonaliteit en de mutagene invloeden (bvb., rookgedrag) te identificeren. De veranderingen in genexpressie, veroorzaakt door deze klonale mutaties, zullen bepaald worden met behulp nieuwe spatiale transcriptomics technologieën. Door de kloon-specifieke spatiale expressie signaturen in kaart te brengen beogen we het eerste bewijs te leveren van de aan- of afwezigheid van klonale afhankelijkheid. Het resultaat van dit project zal een eerste ruimtelijke catalogus van HH mutationele clonaliteit voorzien, wat voor nieuwe inzichten kan zorgen in HH carcinogenese.