Pandemie paraatheid: de ontwikkeling van een gemultiplexte massaspectrometrische assay voor de detectie van pathogenen en de geïnduceerde immuunrespons.

De SARS-CoV-2-pandemie heeft abrupt het gebrek aan paraatheid voor een pandemie geïllustreerd. Daarom hebben gezondheidsorganisaties, zoals de WHO, de ontwikkeling aanbevolen van een robuust moleculair screeningplatform voor vroege detectie en monitoring van pathogenen. Dit houdt in dat de huidige diagnostische tests zoals nucleïnezuuramplificatietests worden aangevuld met tests die zich richten op andere biomoleculen, zoals eiwitten. Daarom is Proteomica veelbelovend als orthogonale testprocedure. Onze eerdere inspanningen met betrekking tot SARS-CoV-2 hebben al aangetoond dat op MS gebaseerde methoden kunnen worden gebruikt als alternatief voor diagnostische tests. Hier stel ik voor om de test uit te breiden door biomerker-peptiden op te nemen voor andere pathogenen, monitoring van aangeboren immuniteit en voor serologische testen. Voor de ontdekkingsfase zal ik een ultramoderne methode van data acquisitie (DIA) gebruiken, namelijk Scanning SWATH. Vervolgens zal ik het gebruik van peptide-immuunverrijkingstechnologie (SISCAPA) introduceren. Dit ontkoppelt de test van de matrix terwijl de gevoeligheid verhoogd wordt tot in het attomole-bereik en zal ik werken aan het automatiseren van monstervoorbereiding en piekdetectie, waardoor de analyse van 500 monsters per dag per MS-instrument mogelijk is. In samenwerking met Sciensano zal grootschalige validatie worden uitgevoerd op patiëntstalen afkomstig van het Severe Acute Respiratory Infections (SARI)-surveillance netwerk.