HET ONTRAFELEN VAN DE ROL VAN CHROMATINE REGULATOREN TIJDENS DE VROEGE HUMANE EMBRYONALE ONTWIKKELING

Chromatine regulatie is cruciaal voor cel lot specificatie tijdens de embryonale ontwikkeling. Ondanks vooruitgang in onze kennis van chromatine processen in zoogdier ontwikkeling, is er nog weinig bekend over hoe chromatine in vroege humane embryo’s wordt gereguleerd. Om de rol van chromatine regulatoren op de cel identiteit van het humaan embryo te bestuderen, zal ik functionele perturbaties, en single-cell technologieën toepassen op stamcel-gebaseerde embryo modellen. Humane pluripotente stamcellen hebben het opmerkelijk vermogen om 3D-embryo-achtige structuren, genaamd blastoids, te vormen. Blastoids lijken op humane embryo’s en bieden een fascinerend platform om de embryogenese te onderzoeken. Om chromatine regulatie in blastoids te bestuderen, ga ik chromatine regulatoren lokaliseren in humane blastoids en embryo’s op proteïne niveau. Vervolgens ga ik chromatine regulatoren verstoren tijdens de blastoid ontwikkeling, en het effect op cel identiteit kwantificeren met moleculaire analyses. Ik zal single-cell transcriptomics en epigenomics gebruiken om het effect van deze verstoringen op het chromatine landschap en genexpressie te analyseren. Deze methoden stellen mij in staat om cis-regulatorische regio’s te identificeren en te valideren, waarvan de disruptie mogelijk gelinkt is met ziekten. Dit project zal de rol van chromatine regulatoren in de vroege humane embryogenese ontrafelen, en daarmee een basis vormen voor verder onderzoek en onvruchtbaarheidsbehandelingen.