De rol van satelliet DNA in bacteriële evolutie.

Bacteriële genomics is een bloeiend onderzoeksveld waarbij verwantschap wordt bepaald via genetische variatie tussen bacteriële strengen. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) worden typisch gebruikt als enige bron van genetische variatie. Het is echter waarschijnlijk dat er meer variatie voorkomt tussen bacteriën. In dit project zal de rol van satelliet DNA in bacteriële evolutie onderzocht worden. Satelliet DNA zal systematisch geïdentificeerd worden in Salmonella Typhimurium en het bacteriële rijk. Daarna zal de dynamica van satelliet DNA en SNPs tijdens de evolutie onderzocht worden. Tot slot zal het effect op de cellulaire transcriptoom respons gemeten en onderzocht worden tussen satelliet DNA en SNPs. Tesamen zullen deze resultaten een uitgebreid zich geven op de rol van satelliet DNA tijdens bacteriële evolutie en een nieuw perspectief werpen op bacteriële genetica.

Trefwoorden:INFECTIES

Disciplines:Fylogenie en vergelijkende analyse, Populatie, ecologische en evolutionaire genetica, Genomics, Transcriptomics, Bacteriologie, Infectieziekten