< Terug naar vorige pagina

Project

De genetische karakterisatie van het S-locus van peer (Pyrus communis): ontrafelen van de functionele rol van de SFBBs in het S-RNase-afhankelijke GSI-systeem aan de hand van de S-haplotype-diversiteit

Peer vertoont, net als veel Rosaceae species, een S-RNase-afhankelijk gametofytisch zelf-incompatibiliteitssysteem (GSI) dat bevruchting door incompatibel pollen verhindert. Het GSI systeem in Pyrus wordt gereguleerd door een polymorf S-locus dat het S-RNase gen en meerdere S-locus F-box (SFBB) genen bevat. Het S-RNase gen komt in de stijl tot expressie, de SFBB genen in het pollen. Ondanks de uitgebreide karakterisering van het S-RNase is er echter nog maar weinig bekend over de identiteit en de werking van de SFBBs, noch over hun specifieke interactie met de verschillende S-RNases. Het doel van het voorgestelde onderzoeksproject is daarom om alle SFBB-genen in het Pyrus S-locus te identificeren en de complexe interactie tussen SFBBs en specifieke S-RNase(s) te ontrafelen aan de hand van de natuurlijke genetische variatie tussen de S-haplotypes. Eerst zullen we mogelijke SFBB-genen identificeren op basis van long-read nanopore sequencing van het genoom van twee Pyrus communis cultivars en assembly van de S-locus haplotypes. Daarna zullen we de voorspelde S-RNAse-SFBB-interacties valideren aan de hand van in vitro en in vivo assays (Y2H, CRISPR-transformatie, enz.). De resultaten van deze studie zullen in hoge mate bijdragen tot ons begrip van de genetische aspecten en moleculaire werking van het GSI-systeem in peer, wat zeer relevant is voor zowel toekomstig onderzoek omtrent de reproductieve biologie van planten als voor interessante toepassingen in de fruitteelt.

Datum:1 okt 2022 →  Heden
Trefwoorden:Self-incompatibility, Pyrus, SFBB
Disciplines:Ontwikkelings- en reproductieve biologie van planten, Gewaswetenschappen, Agrarische landbouw en biotechnologie, Gewasproductie in de tuinbouw