Dynamiek van het Type 3 secretie systeem translocase (DOT3S)

Het type III secretiesysteem voert gespecialiseerde eiwitexport uit. Waar centraal het injectisoom, een miniatuurspuit die eukaryote membranen doorprikt, staat. Hiermee injecteren pathogene bacteriën de gastheer met gifstoffen. Om hun pathogeniteit te onderdrukken, moeten we de structuur en functie van het injectisoom begrijpen. De algemene werkwijze is door bij levende bacteriën injectisoomcomponenten te verwijderen en ze met krachtige microscopen te bekijken. We stellen nu een gewaagde stap voor om onze kennis uit te breiden door te focussen op de bewegingen van de componenten. Deze dynamische benadering houdt in dat we observeren hoe individuele componenten bewegen, weg van de enorme complexiteit van de cel. Dit is mogelijk d.m.v. onze unieke verzameling van geavanceerde complementaire state-of-the-art instrumenten en beweging simulaties m.b.v. krachtige computerclusters. Deze zullen de innerlijke werking van het injectosoom ontrafelen met een focus op de volgorde en verbruik van metabole grondstof voor de werking van de nanomachine, en de interactie van slecht gestructureerde gifstoffen om hiermee geëxporteerd te worden. Dit is een uitdagende doelstelling o.w.v. de niet geëxploreerde dynamische aard van het injectisoom en de technische complexiteit, maar onze group beschikt over de nodige expertise om dit aan te pakken. Want als we deze geweldige nanomachine beter begrijpen, hopen we toekomstige oplossingen voor ziektebestrijding te inspireren.