Hergebruik van geneesmiddelen om pathogene biofilms te remmen en de activiteit van antibiotica te versterken (DRIPBEAT)

Bacteriële biofilms zijn nauw verbonden met chronische infecties, wat leidt tot een veel hogere tolerantie voor antibiotica en mislukte behandelingen. Nieuwe strategieën voor verstoring van de biofilm zijn dus dringend nodig. Cyclic-di-GMP, een secundaire boodschapper die de vorming van biofilm bevordert, is een veelbelovend doelwit voor geneesmiddelen. Tot nu toe werden slechts enkele verbindingen geïdentificeerd die de c-di-GMP-niveaus verlagen en biofilms remmen, en de meeste onderzoeken werden in vitro uitgevoerd met behulp van standaardmedium- en referentiestammen. In dit project zullen geneesmiddelen worden hergebruikt voor het richten op c-di-GMP en biofilms om de antibioticagevoeligheid van klinische Pseudomonas aeruginosa-stammen te vergroten. Interdisciplinaire benaderingen zullen worden toegepast, waarbij next generation sequencing, analyse van genexpressie in synthetisch sputum, structurele eiwitmodellering en computationele drugdocking, longepitheelcelinfectie en muizenmodel worden gecombineerd. Dit project zal de nauwkeurigheid van het ontdekken van geneesmiddelen op basis van c-di-GMP vergroten en de vaardigheden van een early career researcher sterk uitbreiden. De nieuwe kennis in menselijke celcultuur en muizenmodel die in deze fellowship wordt verkregen, zal cruciaal zijn voor de onderzoeker met een langetermijninteresse in infectiebehandeling. Het gastlaboratorium van de Universiteit Gent (UGent), een toonaangevende groep in Europa die combinatietherapie tegen biofilms onderzoekt, biedt een uitstekende sfeer die zowel technische als overdraagbare vaardigheden bevordert. De onderzoeker zal ook profiteren van het uitgebreide onderzoeksnetwerk van de promotor en de talrijke opleidingsprogramma's die de UGent aanbiedt om de toekomstige loopbaanperspectieven te verbeteren. De onderzoeksresultaten zullen nieuwe inzichten opleveren in hoe genetische en omgevingscondities de c-di-GMP-route beïnvloeden (basiswetenschap) en hoe meer geschikte verbindingen kunnen worden geselecteerd voor de behandeling van biofilm (toegepaste wetenschap), en kunnen ook worden onderworpen aan klinische proeven en industriële bedrijven aantrekken.