< Terug naar vorige pagina

Project

Uitbreiding van de forensische toolbox: het gebruik van Data-Onafhankelijke Massaspectrometrie voor forensisch peptide marker ontdekking en MRM testontwikkeling.

In forensisch onderzoek regeert DNA als het gaat om identificatie van personen. Echter, sommige toepassingen kunnen geen gebruik maken van DNA-genotypering, zoals de identificatie van de biologische matrix dat cruciaal kan zijn bij het bepalen van wat er precies gebeurd is. Daarnaast bevat biologisch bewijsmateriaal, zoals oudere stalen, vaak weinig, beschadigd of geen DNA. Daarom is massaspectrometrische (MS) proteomics veelbelovend voor forensisch onderzoek. MS-methoden kunnen zowel zuivere als mengsels van biologische matrices van verschillende diersoorten identificeren zonder staalverlies, zodat het volledige spoor behouden blijft voor DNA-extractie. Echter, met het doel biomerkers te vinden, wordt de state-of-the-art data-afhankelijke acquisitie (DDA) MS beperkt door zijn stochastische aard. Data-onafhankelijke acquisitie (DIA) MS kan hiervoor een oplossing bieden. Bij DIA-MS worden peptiden continu gefragmenteerd. Dit genereert een digitale kopie van het staal dat zowel meer kwalitatief als kwantitatief is in vergelijking met DDA. M.b.v. onze nieuwste innovatie, de combinatie van narrow window DIA met in silico voorspelde spectrale bibliotheken, kunnen we dieper in de proteomen graven dan ooit tevoren. Even belangrijk is dat narrow window DIA compatibel is met targeted MS op tandem quadrupool instrumenten. In conclusie, DIA-analyse van forensische stalen zal nieuwe biomerkers opleveren die kunnen worden gebruikt in multiple reaction monitoring (MRM)-gebaseerde assays.

Datum:1 okt 2021 →  Heden
Trefwoorden:Massaspectrometrie, Proteomics, Forensische geneeskunde
Disciplines:Medische proteomics, Stamcelbiologie, Spectrometrie, Epigenetica