Ontwikkeling van een nieuw protocol voor metallo-organische roosters (MOFs) als artificiële enzymen in proteomics-toepassingen

Dit project ontwikkelt een makkelijk toepasbaar, chemisch splitsingsprotocol dat gebruik maakt van metallo-organische roosters (MOFs) als artificiële proteasen voor middle down proteomics toepassingen. MOFs zijn heterogene katalysatoren die robuust, kosteneffectief en gemakkelijk recycleerbaar zijn. Selectieve hydrolyse is van groot belang in proteomics en analytische biochemie, hoewel de hydrolyse van de peptidebinding onder biologisch relevante condities een uitdagende taak blijft. In dit project maken we gebruik van MOFs als aantrekkelijk alternatief voor enzymen of chemische reagentia in eiwitsplitsing. MOFs zullen een niet-toxisch alternatief zijn, toegepast onder milde reactie-condities in tegenstelling tot de meest gangbare chemische methoden. Zij dragen niet bij tot contaminatie van eiwitstalen, in tegenstelling tot trypsine. Detectie van post-translationele modificaties (PTM's), vaak gerelateerd met menselijke ziekten, is moeilijk met de gebruikelijke proteomics-toepassingen. Resultaten van de groep van Prof. Parac-Vogt tonen aan dat MOF's fragmenten genereren met lengte ideaal voor 'middle down' proteomics, wat wijst op een potentiële, belangrijke doorbraak in PTM-detectie.