Naar de ontwikkeling van nieuwe hulpmiddelen voor de ontdekking van paden voor de afbraak van plastics uit meta-omicsgegevens

Het project maakt deel uit van een consortium 'PlasticDaphnia' met als doel de reactie van de ongewervelde watervlo Daphnia en zijn microbioom op vervuiling door microplastics (MP) te onderzoeken, en het te ontwikkelen als een innovatief testsysteem voor het identificeren van risico's en biologische afbreekbaarheid van bestaande en nieuwe MP polymeren in oppervlaktewaterecosystemen. De filtervoeder Daphnia bezit een divers microbioom waarvan bekend is dat het biologisch afbreekbare eigenschappen bezit. Bovendien is aangetoond dat Daphnia in zoetwaterecosystemen giftige deeltjes en MP's concentreert, dus het bestaan van unieke genfuncties die verband houden met (bio)plastic polymeer- en monomeerafbraak is zeer waarschijnlijk. Het doel van mijn project is om meta-omics data van Daphnia microbiomen te onderzoeken om een nieuwe analysepijplijn te ontwikkelen, en deze toe te passen om de werking van dergelijke functies te rapporteren en te kwantificeren. Bovendien zal de ontwikkelde tool worden gebruikt om de biologische afbraakroutes van MP en de varianten die aanwezig zijn in het Daphnia-microbioom op een soortspecifieke manier in kaart te brengen. Uiteindelijk zal de output van het project de ontwikkeling van Plastic Daphnia ondersteunen als een innovatief en op maat gemaakt testsysteem dat een betere beoordeling van de veiligheid en biologische afbreekbaarheid van MP-polymeren mogelijk maakt.