Elektrofysiologische studie & biotechnologische toepassing van de curli secretie en assemblage machinerie. (FWOSB104)

Curli fibers zijn het grootste bestandsdeel van de extracellulaire matrix gevormd door Gram-negatieve bacteriën in een biofilm. Curli zijn fibers die behoren tot de klasse van functionele amyloïden, vanwege hun productie door een toegewijde bio synthetische pathway. De pathway bestaat uit verschillende curli specifieke genen, (csg), welke de curli eenheden vormen. In dit project worden de interacties tussen CsgA, de fiber vormende subunit, en het translocatie en assemblage complex gevormd door: het membraan kanaal CsgG, het periplasmatische CsgE, en de fiber assemblage factor CsgF. Interactie dynamica worden gekarakteriseerd door middel van een elektrofysiologische technieken in lipide dubbellagen. Preliminaire structurele data wijst naar dynamische staten van CsgF. Dit wordt opgevolgd met elektrofysiologie en het effect van CsgA hier op bekeken. De interactie tussen CsgE, CsgA en CsgG zullen op eenzelfde manier worden onderzocht. Recent is aangetoond dat CsgA bindt aan de buitenkant van CsgG, dit is in tegenstrijd met de huidige modellen die postuleren dat CsgE CsgA recruiteerd naar CsgG. Hiernaast zal dit project de huidige kennis van de curli pathway integreren om voor de toepassing in Nanopore sensing. Selectieve detectie van eiwitten zal worden mogelijk gemaakt door de introductie van nanobodies. In het kort zal dit project doormiddel van elektrofysiologie curli sub unit interacties bestuderen en met behulp van de opgedane kennis, nanopore sensing applicaties realiseren.

Trefwoorden:Bacteriële biofilms, Curli-afscheiding en montage, Bacterieel buitenmembraan transport, Nanopore-detectie

Disciplines:Proteïnen, Bacteriologie, Membraanstructuur en -transport, Medische biotechnologie-gerelateerde diagnostiek