< Terug naar vorige pagina

Project

lading-voorkeur van het Zoogdier eiwit kwaliteitscontrole mechanisme

Een groot aantal componenten van de cellulaire machinerie die instaat voor kwaliteitscontrole van eiwitten (Protein Quality Control network of PQC) binden specifiek aan hydrofobe segmenten verrijkt met positief geladen residu’s. Tot voor kort ontbrak een logische verklaring hiervoor. Meer dan tien jaar geleden toonde het Switch lab aan dat hydrofobe segmenten met de neiging te aggregeren (zogenaamde Aggregation-Prone Regions of APR’s) systematisch geflankeerd worden door geladen residu’s. Dezen werden Aggregation GateKeepers (GKs) genoemd, omdat ze de neiging tot aggregeren van de APR die ze flankeren verminderen. Recent onderzoek van het Switch lab toonde een nauw verband tussen GKs en chaperones: er werd aangetoond dat DnaK, de Hsp70 homoloog uit E. coli, specifiek positief geladen GKs herkent vanwege hun relatief slechte aggregatie-brekende capaciteit. De ladingsvoorkeur van het PQC kan dus worden gerationaliseerd als een herkenningsmechanisme voor APRs met slechte GKs. Het doel van dit proefschrift is om de recente vooruitgang in protein proximity labeling door middel van biotineligatie te benutten om een proteoom-wijde screen uit te voeren voor GK-specifieke APR-interactoren in zoogdiercellen. Op deze manier willen we onze eerdere bevindingen uitbreiden naar een zoogdiercontext en de PQC-ladingsvoorkeur definitief bevestigen. Bovendien zal deze screen mogelijk niet eerder geïdentificeerde GK-specifieke PQC-elementen opleveren, die zowel in vitro als in vivo grondig zullen worden gekarakteriseerd.

Datum:19 mrt 2021 →  Heden
Trefwoorden:Protein quality control machinery, Charge preference, GK-specific APR interactors
Disciplines:Proteïnen
Project type:PhD project