Dynamica van cytomegalovirus infecties: de evolutie naar geneesmiddelenresistentie

Herpesvirussen zijn grote DNA-virussen die een levenslange latentie tot stand brengen na een primaire infectie. Wanneer het immuunsysteem van de gastheer verzwakt is, kunnen ze reactiveren en een significante morbiditeit en mortaliteit veroorzaken. Er zijn slechts enkele antivirale middelen toegestaan voor profylaxe en behandeling van ziektes veroorzaakt door humane herpesvirussen. De verschijning van drug-resistentie is een grote zorg voor personen met immuundeficiëntie. Herpesvirussen coderen voor een DNA-polymerase met een proofreading capaciteit en worden als genetisch stabiel beschouwd. Ze kunnen echter snel evolueren in reactie op een selectieve druk (bv. antivirale medicatie). Mutaties in het 3’-5’ exonuclease domein van het DNA-polymerase kunnen de getrouwheid van het enzym verlagen en leiden tot een verhoogde mutatiesnelheid in een zogenaamd mutator fenotype. In dit project zullen we potentiële mutator fenotypes in humaan cytomegalovirus en herpes simplex type 1 en 2 bestuderen aan de hand van de Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR) en CRISPR-associated protein 9 (Cas9) technologie en next-generation sequencing (NGS). De DNA-polymerase mutaties die bestudeerd zullen worden werden eerder geïdentificeerd in klinische stalen of na in vitro selectie onder antivirale druk. De impact van deze mutaties op de biologische eigenschappen, genetische diversiteit en pathogeniteit van humane herpesvirussen zal bepaald worden.