Eco-evolutionaire dynamiek van de darmmicrobiota

De darmmicrobiota is samengesteld uit meerdere soorten micro-organismen die belangrijke functies hebben voor de gezondheid van de menselijke gastheer. Deze microbiële gemeenschappen zijn het resultaat van complexe relaties tussen de afzonderlijke componenten, maar gedetailleerde kennis over deze dynamiek tussen soorten, hun evolutie en reactie op externe factoren blijft schaars. Dit project zal de eco-evolutionaire dynamiek tussen belangrijke soorten en stammen van de menselijke darmmicrobiota onderzoeken door experimentele evolutie en bioinformatische analyses te combineren. De belangrijkste onderzoeksdoelstellingen zijn: (1) Het karakteriseren van de soorten relaties tussen microbiële darmsoorten; (2) om genetische veranderingen (mutaties en genstromen tussen soorten) te identificeren die ons kunnen helpen om adaptieve evolutie in de menselijke darm te begrijpen; en (3) onderzoeken hoe abiotische factoren (kweekmedia, koolhydraten in de voeding, zuurstof, antibiotica,…) deze intersoortrelaties en evolutionaire processen beïnvloeden. Een beter begrip van deze processen zal van grote waarde zijn voor het rationeel ontwerp van probiotica en voor de behandeling van darmgerelateerde infectieziekten.